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Nanobody-Tn5,赋予CUTamp;Tag不一样的体验.pdfVIP

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乐民之乐者,民亦乐其乐;忧民之忧者,民亦忧其忧。——《孟子》

Nanobody-Tn5,赋予CUTTag不一样的体验CUTTag技术,作为研究蛋白质-

DNA互作的新兴技术,从问世之初,就一直备受关注。Nanobody(纳米抗体)在

药物抗体研究中的风很大,在医药领域备受青睐。那纳米抗体怎么就与CUTTag

关联上了呢?

2022年12月,GonçaloCastelo-Branco课题组和美国纽约基因组中心Ivan

Raimondi团队同期在NatureBiotechnology上发表了关于nanobody-Tn5的文

章。

Nanobody-Tn5主要是将纳米抗体与Tn5转座酶进行融合,制备出可结合两种不同

物种(小鼠和兔)一抗的anti-mouseTn5和anti-rabbitTn5。这两种

nanobody-Tn5中包埋了含不同index的接头序列,Tn5切割染色质时,接头插入到

染色质中,通过不同的index来区分来源于mouse的一抗靶向区域还是来源于

rabbit一抗靶向的区域。关于这两篇文章,NatureBiotechnology杂志也给出了

回应:这两篇论文的主要创新是在检测中使用纳米抗体,可以测量单个细胞中两种

或更多组蛋白修饰的全基因组存在,以及细胞表面蛋白表达(NTT-seq)或染色质可

及性(Nano-CT)。这种方法使我们能够在更高的水平上以高灵敏度和准确性观察复

杂的单个细胞表观基因组研究。

2023年3月,翌圣生物Multi-CUTTag试剂盒(

CUTTag2for1照进现实,

Multi-CUTTag试剂盒),产学研合作,推出了利用nanobody-Tn5(anti-rabbit

tn5和anti-mousetn5)组成的Multi-CUTTag标准化试剂盒,实现了一份样

本,两种靶标的标准操作。

关于这个利用nanobody-Tn5(anti-rabbittn5和anti-mousetn5)组成的

Multi-CUTTag标准化试剂盒的性能大家也很期待吧,来,我们上一波数据吧!

01H3K4me1

将H3K4me1使用常规的CUTTag试剂盒以及使用nanobody-Tn5的试剂

盒进行单靶标和多靶标建库并上机测序,结果如下:

乐民之乐者,民亦乐其乐;忧民之忧者,民亦忧其忧。——《孟子》

图.H3K4me1使用常规CUTTag试剂盒和Multi-CUTTag试剂盒结果图

使用常规CUTTag试剂盒以及Multi-CUTTag试剂盒做单靶标时,结果差异不

大,在某些位点上,Multi-CUTTag信号更明显。Multi-CUTTag做双靶标实验

时,联合其他抗体(K3K27ac、H3K4me3、H3K36me3)均能拆分并且分析结果与

单靶标结果一致。

02H3K4me3

将H3K4me3使用常规的CUTTag试剂盒以及使用nanobody-Tn5的试剂盒进行单

靶标和多靶标建库并上机测序,结果如下:

图:H3K4me3使用常规CUTTag试剂盒和Multi-CUTTag试剂盒结果图

使用常规CUTTag试剂盒以及Multi-CUTTag试剂盒做单靶标时,结果差异不

大。Multi-CUTTag做双靶标实验

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