蛋白质组学研究内容和相关技术.pdfVIP

以家为家，以乡为乡，以国为国，以天下为天下。——《管子》

一、什么是蛋白质组？与基因组差别？蛋白质组学的主要研究内容及技术体

系？

答：蛋白质组：Proteome，源于蛋白质（protein）与基因组（genome）两个词的组合，

意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白

质。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，

翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢

等过程的整体而全面的认识，这个概念最早是由MarcWilkins在1994年提出的。

基因组：Genome，一个细胞或者生物体所携带的一套完整的单倍体序列，包括全套基

因和间隔序列。可是基因组测序的结果发现基因编码序列只占整个基因组序列的很小一部

分。因此，基因组应该指单倍体细胞中包括编码序列和非编码序列在内的全部DNA分子。

二者区别：蛋白质组研究和基因组研究依然是形影相随的两个重要领域，它们之间既为

互相补充又能互相帮助，但二者之间仍有一些区别：

蛋白质组：多样性，无限性，动态性，空间性，互相作用。

基因组：同一性，有限性，静态性，周期性，孤立性。

蛋白质组学的主要研究内容：

（1）表达蛋白质组学(expressionproteomics)：是对蛋白质组表达模式的研究，即检测细

胞、组织中的蛋白质，建立蛋白质定量表达图谱，或扫描表达序列(EST)图谱。在整个蛋白

质组水平上提供了研究细胞通路、疾病、药物相互作用和一些生物刺激引起的功能紊乱的可

能性，对寻找疾病诊断标志、筛选药物靶点、毒理学研究等具有重要作用。

（2）细胞图谱蛋白质组学(cellmapproteomocis)：是对蛋白质组功能模式的研究，即确

定蛋白质在亚细胞结构中的位置和鉴定蛋白质复合物组成等，便于研究蛋白质在细胞内的行

为、运输及蛋白质相互作用网络关系，它对确定蛋白质功能和疾病诊疗的靶位极有价值。

蛋白质组学技术体系：

（1）蛋白质组学分离技术，在整个蛋白质组学的研究中，分离技术是最基础的部分。

如何实现对复杂的蛋白质样品或者其酶解产物进行有效的分离，是对样品做后续鉴定的先决

条件。目前蛋白质组学常用的分离技术主要有两种类型，一是凝胶技术，主要包括双向凝胶

电泳（2-DE）技术以及后来出现的双向荧光差异凝胶电泳技术（2D-DIGE）；二是非凝胶

技术，主要是色谱(LC)技术，尤其是高效液相色谱（HPLC）和多维液相色谱（MDLC）。

（2）蛋白质组学鉴定技术，在蛋白质组学研究流程中，蛋白质鉴定技术是最关键的部

分。质谱技术在二十世纪初就已出现，但一直仅应用于有机小分子领域，直到八十年代才渐

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渐应用到生物大分子领域。经过二十多年来的应用和发展，质谱技术已是蛋白质组研究中必

不可少的工具，并成为蛋白质组研究中的主要支撑技术。根据离子化源的不同，质谱主要可

以分为电喷雾电离质谱（ESI-MS）和基质辅助激光解析电离质谱（MALDI-MS）两大类。

（3）蛋白质组学定量技术，蛋白质组学的研究目的是以大规模的尺度研究细胞内蛋白

质的功能，这种研究要走向成熟必然要脱离对蛋白质的简单鉴定，实现对蛋白质的表达水平

及其变化的检测。因此，定量技术应该说是整个蛋白质组学的精华部分。而这种定量通常不

必是检测蛋白质在细胞内的绝对含量，而只需对其相对含量进行定量即可。目前，蛋白质组

研究中应用的比较成熟和可信的定量策略和方法主要有两种。一种是基于传统双向凝胶电泳

及染色基础上的定量，另外一种是基于质谱检测技术的定量。