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士不可以不弘毅，任重而道远。仁以为己任，不亦重乎?死而后已，不亦远乎?——《论语》

生物信息学领域的基础研究

绪论

随着现代基因组学的发展，越来越多的生物信息数据出现在公

共数据库中，生物信息学因此得到了迅猛的发展。生物信息学是

从计算机科学和信息学到生物学、化学和统计学的跨学科领域，

其目的在于发现和应用生物信息数据的内在规律。其中，基础研

究是生物信息学领域重要的一环。基础研究是奠定应用研究及创

新研究成果的基础，它包括研究生命系统的基本结构、功能、特

点、演化、调控及相关技术的发展。

一、生物信息学领域的基础研究涵盖的内容

1.基因组学

基因组学是研究基因组的构成、结构、功能以及演化等方面的

学科。对于生物信息学领域的基础研究而言，基因组学是优先的

一个领域。随着测序技术的不断发展，越来越多的物种的基因组

数据被测序出来，从而为基因组学研究提供了丰富的数据。近年

来，科学家们利用基因组数据，研究物种的演化历程、基因功能

及底层基因调控等问题。

2.转录组学

转录组学研究生物体在特定时期或组织中的所有RNA分子的

整体表达谱，为研究基因的表达及调控提供了全局性的认识。转

士不可以不弘毅，任重而道远。仁以为己任，不亦重乎?死而后已，不亦远乎?——《论语》

录组学在生物信息学中是基础研究重要领域之一，其中的研究方

法包括RNA测序及微阵列芯片等。

3.蛋白质组学

蛋白质组学在生物信息学中是涵盖范围广、应用前景广阔的领

域之一。随着离子迁移谱、质谱成像和蛋白质互作技术以及电泳

技术和免疫学技术等的不断发展，生物信息学中的蛋白质组学实

现了从单个蛋白物质到整个蛋白质组的研究。

4.生物信息学算法及模型

生物信息学算法及模型是生物信息学领域的基础研究，其研究

的内容包括生物数据分析、序列比对、蛋白质结构预测及机器学

习等。这些算法及模型为生物信息学的发展奠定了坚实的基础。

5.生物网络学

生物网络学研究生物大分子之间及小分子和大分子之间的互作

关系和网络结构，并通过分析网络结构寻找关键节点，根据网络

分析结果推断生物系统的运转方式和规律。生物网络学是生物信

息学中的一个新兴领域，其为生命科学从单个基因分子水平向整

个生物体和种群水平的认识提供了一种新的视角。

二、生物信息学领域的基础研究目标

生物信息学领域的基础研究目标主要包括以下几个方面：

士不可以不弘毅，任重而道远。仁以为己任，不亦重乎?死而后已，不亦远乎?——《论语》

1.建立基因组和转录组的数据库

建立基因组和转录组的数据库能够方便科研人员对生物的研究

和应用。目前，已经建立了多个物种的基因组和转录组数据库，

如Humangenome、Ensembl、NCBI等。

2.提高生物数据处理的精准度和信度

随着生物信息学的发展，如何处理大量的生物数据成为了科学

家们的一个难题。因此，提高生物数据处理的精准度和信度是生

物信息学领域基础研究的目标之一。为此，科学家们开发了一系

列的算法和软件用于对生物数据的处理及分析，如BLAST算法、

物种分类学、序列比对等。

3.探索生物组成和功能的关系

生物组成和功能的关系对于生物信息学研究具有重要的意义。

生物信息学基础研究通过研究生物的基本结构、功能、调控和演

化，探索生物组成和功能之间