第五章BrainNetViewerGuide使用范例.pptxVIP

第五章BrainNetViewer使用范例本章将向您介绍如何使用BrainNetViewer可视化分析大脑网络数据。您将学习如何导入数据、配置节点和边、调整展示效果等。通过这些实践应用,您将对如何利用BrainNetViewer进行高效的大脑网络可视化有更深入的理解。作者：

BrainNetViewer简介BrainNetViewer是一款基于MATLAB的可视化软件,能够帮助研究人员直观地分析和理解基于图论的脑网络结构和功能特性。它支持多种类型的脑网络数据可视化,包括解剖连接、功能连接和动态连接等。通过BrainNetViewer,研究人员可以更好地探索和分析脑网络的复杂拓扑特征。

BrainNetViewer功能概述绘制脑网络拓扑BrainNetViewer可以将复杂的脑连接数据可视化成网络图,帮助直观地展示大脑的结构和功能联系。丰富的分析工具它包含了常见的网络拓扑特征分析,如度中心性、介数中心性、社团划分等,为研究提供广泛的支持。灵活的定制化用户可以灵活调整各种参数,如节点大小、颜色、边宽度等,以满足不同的分析需求。交互式浏览软件提供旋转、缩放等交互功能,使得用户能更好地探索和理解复杂的脑网络结构。

数据准备1数据收集从各种渠道收集所需的功能连接和结构连接矩阵数据2数据预处理对数据进行格式转换和噪声滤波等预处理步骤3数据输入将预处理后的数据导入BrainNetViewer进行可视化分析在进行脑网络图可视化分析之前,需要对所需的数据进行仔细的收集和预处理。首先,从不同来源如实验数据、公开数据库等收集功能连接矩阵和结构连接矩阵等所需数据。然后,对这些数据进行格式转换、噪声滤波等预处理,确保数据质量。最后,将准备好的数据输入到BrainNetViewer中,开始可视化分析。

可视化脑网络图三维脑网络可视化BrainNetViewer可以将复杂的脑连接网络以三维图形的方式呈现,使用丰富多彩的节点和边来表示大脑的结构和功能连接。连接矩阵可视化这种二维的连接矩阵可视化形式直观地展示了大脑区域之间的连接强度关系,为后续的网络属性分析奠定基础。交互式视角控制用户可以通过缩放和平移等交互操作,从不同角度观察和探索脑网络的复杂结构,深入了解大脑连接的整体布局。

定制节点和边的属性调整节点样式可以调整节点的大小、颜色、形状等属性,使其更清晰地凸显网络结构。可根据节点的重要性或其他指标对节点进行差异化渲染。自定义边属性可以调整边的粗细、颜色、透明度等属性,以突出重要的连接关系。可以根据边权重或类型应用不同的视觉编码。标注节点信息在节点上添加标签,显示节点的名称、属性等信息,以增加可读性和信息量。可根据需要调整标签的大小、颜色等。高亮关键元素通过调整特定节点和边的属性,如放大、添加轮廓等,可突出显示网络中的关键节点和关键连接。

设置视图参数1调整观察角度通过拖动、缩放和旋转等操作,可以灵活调整观察视角,以获得最佳的网络结构展示效果。2选择合适视图模式提供多种2D和3D视图模式,可以根据具体分析需求选择最适合的视图。3个性化节点和边呈现可定制节点和边的大小、颜色、透明度等属性,突出关键信息并增强视觉效果。4保存和导出可视化结果生成的可视化结果可以保存为高清图像或视频文件,以便进一步分析和演示。

网络属性分析1拓扑特征分析网络的整体特点,如密度、聚类系数、传递性等2节点特征识别关键节点,如度中心性、介数中心性等3子网结构发现社区结构、模块性等网络社区特征网络属性分析是BrainNetViewer的核心功能之一,通过多种指标全面描述脑网络的拓扑结构特点,发现其中隐藏的模式和规律。这为我们深入理解大脑功能组织提供了重要的理论基础。

网络节点度中心性分析节点度中心性是了解脑网络中哪些区域在整个网络中扮演重要枢纽角色的关键指标。它反映了某个节点与其他节点的连接强度。我们可以通过可视化节点度分布,识别出网络中关键节点,并分析它们在功能整合中的作用。5最高度五个网络中心度最高的节点20%高度节点占比整个网络中度数最高的20%节点0.82平均度数整个网络的平均节点度数0.65最高度/平均度最高度与平均度的比值,反映了网络异质性

网络边介数分析边介数是衡量一个边在网络中的重要性的关键指标。它表示该边位于网络中两个节点间最短路径的数量。边介数高的边在连接脑网络各部分方面扮演着重要的中介角色。边介数网络结构意义高该边在连接网络关键区域中起重要作用低该边在网络中的重要性相对较小边介数分析可帮助识别脑网络中最关键的连接通路,为理解大脑功能组织提供重要线索。

社团划分分析社团划分分析是BrainNetViewer中一个重要的功能特性。通过对大脑连接网络进行聚类分析,可以识别出具有紧密内部连接但较弱外部连接的子网络结构,即所谓的社团。社团划分可以揭示大脑网络的模块性组织,反映