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高性能计算机系统应用指南.doc

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高功能计算机系统应用指南

TOC\o1-2\h\u2735第1章高功能计算概述 4

38561.1高功能计算的发展历程 4

255831.1.1巨型机时代 4

275841.1.2小型机与向量机时代 4

316631.1.3分布式计算时代 4

260261.2高功能计算机系统的架构 4

272851.2.1单处理器架构 4

88781.2.2向量处理架构 4

142171.2.3大规模并行处理架构 4

195721.2.4分布式计算架构 5

129061.3高功能计算的应用领域 5

299101.3.1科学研究 5

269661.3.2工程技术 5

200891.3.3生物信息学 5

136601.3.4金融分析 5

254101.3.5能源与环保 5

3981.3.6人工智能与大数据 5

32669第2章硬件选型与配置 5

183802.1处理器选型 5

1572.2存储系统配置 6

227202.3高速网络与互连技术 6

257312.4GPU与加速卡选择 7

28900第3章软件环境与工具 7

143913.1操作系统选择 7

272713.1.1Linux操作系统 7

45253.1.2Windows操作系统 8

74673.2编程模型与编程环境 8

16163.2.1MPI编程模型 8

155453.2.2OpenMP编程模型 8

178933.2.3编程环境 8

244063.3功能优化工具 9

14263.3.1功能监控工具 9

181453.3.2功能分析工具 9

9883.3.3编译器优化选项 9

131543.4虚拟化与容器技术 9

301753.4.1虚拟化技术 9

281443.4.2容器技术 10

28434第4章高功能计算算法与优化 10

306874.1算法设计与分析 10

82694.1.1算法设计原则 10

266714.1.2算法功能分析 10

286614.2并行算法与优化 10

44954.2.1并行算法设计方法 11

154714.2.2并行算法优化策略 11

75444.3向量化与SIMD技术 11

254214.3.1向量化技术 11

279514.3.2SIMD技术 11

150634.4高功能计算库与框架 11

224384.4.1MPI(MessagePassingInterface) 11

227434.4.2OpenMP(OpenMultiProcessing) 11

213974.4.3CUDA(ComputeUnifiedDeviceArchitecture) 11

63604.4.4OpenCL(OpenComputingLanguage) 12

22346第5章科学计算应用实践 12

95205.1结构力学模拟 12

174035.1.1模型建立 12

85935.1.2网格划分 12

83525.1.3边界条件设置 12

191895.1.4计算方法 12

185875.1.5结果分析 12

164225.2流体力学计算 12

53135.2.1控制方程 13

325535.2.2数值方法 13

311005.2.3边界条件与初始条件 13

182575.2.4网格划分 13

110335.2.5结果分析 13

196715.3量子化学计算 13

85875.3.1基本理论 13

210185.3.2计算方法 13

243485.3.3基组选择 13

71605.3.4边界条件与计算设置 13

148295.3.5结果分析 14

86745.4生物信息学应用 14

97815.4.1序列比对 14

80865.4.2结构预测 14

121805.4.3系统进化分析 14

75905.4.4基因组学应用 14

5115.4.5结果分析 14

28466第6章大数据与高功能计算 14

100006.1大数据技术概述 14

221466.2高功能计算在大数据处理中的应用 15

6966.3分布式存储与计算 1

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