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ICS11.220
B
团体标准
T/CVMAXXXXX—XXXX
核测纳米孔测序法
病原酸检
acidnsequencingMethod
ctiofgenicNucleicNaopore
DetenOPatho
(
征求意见稿)
XXXX-XX-XX发布XXXX-XX-XX实施
中国兽医协会发布
XX/TXXXXX—XXXX
病原核酸检测纳米孔测序法
1范围
本文件规定了基于纳米孔测序的病原核酸检测方法的试剂、仪器与耗材、操作步骤、结果分析和实
验室生物安全要求等内容。
本文件适用于各级各类兽医实验室开展基于纳米孔测序的病原核酸检测。
2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,
包括所有的修改单)适用于本
仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(
文。
件
生通用要求
GB19489实验室物安全
GB/20
T0014
.-2015标准编写规则第4部分:试验方法标准
NY/5
T41兽医断样品采
诊集、保存与运技
输术规范
NY/T19通
48兽医实验室生安全要求则
物
GB/T30989-2014高通量基因测序技术规程
3术语和定义
3.1序列数Reads
匹配到目的微生物的序列数。数值越高表示样本中检测到该微生物的可信度越高。
3.2测序深度Depth
样本中某个指定的核苷酸被检测到的次数。数值越大表示样本中检测到的该微生物的可信度越高。
3.3覆盖度Coverage
检测到某微生物的序列覆盖到该微生物全基因组的比值。覆盖度越高表示检测到某微生物的序列覆
盖到该微生物全基因组的比值越高。
1
XX/TXXXXX—XXXX
3.4微生物丰度Abundance
丰度越高表示其在相同类型微生物中
该微生物在整个样品中检测到的相同类型微生物中所占比重。
所占比例越高。
4原理
技理是将
三代纳米孔测序技术(Nanopore)平台是最新一代的单分子实时测序平台,其核心的术原
多个纳米孔蛋白固定在电阻膜上,在膜两侧施加不同的电压产生电压差,DNA链在马达蛋白的牵引下,
解螺旋通过纳米孔蛋白。由于DNA属于生物大分子,不同碱基本身带有不同电荷,因此通过纳米孔时
会引起电阻膜上
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