拟南芥和水稻环形RNA在生物胁迫中的功能研究.pdf

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摘要I

ABSTRACTIII

缩略词表VI

第一章文献综述1

1植物免疫系统研究进展1

1.1病原物模式分子触发的免疫反应1

1.2病原物效应蛋白触发的免疫反应2

2环形RNA的研究进展3

2.1环形RNA的发现历程3

2.2环形RNA的产生机制4

2.3环形RNA的分类7

2.4环形RNA的特征8

2.5环形RNA的功能10

3植物环形RNA响应生物胁迫12

4本研究的目的和意义12

第二章拟南芥circR5998在生物胁迫中的机制研究15

1材料与方法15

1.1培养基的配制15

1.2供试拟南芥植株的培养16

1.3供试菌株16

1.4转基因拟南芥的筛选与验证16

1.5蘸花转化法20

1.6种子的消毒处理21

1.7丁香假单胞菌的活化与菌液配制21

1.8拟南芥HR反应22

1.9拟南芥ROS反应22

1.10拟南芥中假单胞菌的生长量检测22

1.11荧光定量PCR法检测表达量23

2结果与分析23

I

拟南芥和水稻环形RNA在生物胁迫下的功能研究

2.1确立circR5998转基因植物的初筛方案24

2.2CircR5998-OE植物的筛选和验证25

2.3CircR5998负调控其母本线性基因27

2.4CircR5998不影响植株生长发育28

2.5CircR5998-OE植物免疫表型的筛选29

2.6CircR5998响应细菌胁迫的机制探索32

2.7CircR5998影响植物PCD36

3讨论与结论37

第三章水稻环形RNA的特征分析与鉴定39

1材料与方法39

1.1供试水稻植株的培养39

1.2供试菌株的营养生长与生殖生长39

1.3培养基的配制40

1.4稻瘟病菌的侵染40

1.5水稻RNA的提取40

1.6RNaseR处理水稻RNA40

1.7mRNA富集处理41

1.8环形RNA的反转录41

1.9环形RNA特异性引物的设计41

1.10测序相关信息42

2结果与分析43

2.1水稻体内不存在circRNA599843

2.2水稻环形RNA的产生位点和特征分析45

2.3水稻在生物胁迫下差异表达的环形RNA的产生位点和特征分析47

2.4水稻环形RNA的初步鉴定53

3讨论与结论56

全文总结57

论文创新点及不足之处59

参考文献61

基金项目73

致谢75

II

目录

III

摘要

拟南芥和水稻环形RNA在生物胁迫中的功能研究

摘要

CircularRNAs(circRNAs,环形RNA)是一类首尾相接呈闭合环状的RNA分

子,既不含5’帽子结构也不含3’末端多聚腺苷酸化尾,因其具有物种丰富性等特点,

吸引了学者们的目

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