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疾病的系統生物學
個性化治療精准藥物,也叫靶向藥物細胞信號轉導網路
個體水準:分子水準:蛋白質DNA科學研究的基本方法細胞水準:
組學研究方法:基因組學:DNA測序轉錄組學:mRNA測序蛋白組學:蛋白鑒定代謝組學:代謝產物鑒定相互組學:以上各組相互作用表型組學:表現基因藥物組學:藥物基因
礦物油誘導的類風濕性關節炎(RheumatoidArthritis,RA)
表觀遺傳學分析
表觀學觀察
染色體圖譜
染色體上的基因圖譜
染色體上基因區別
轉基因
《Naturegenetics》
問題Ncf1只在巨噬細胞上表達,不在T細胞上表達;轉移DA鼠的T細胞,到DA.Ncf1a/b鼠,後者發病;DA鼠的T細胞上,有什麼致病信號?
組學研究方法:基因組學:DNA測序轉錄組學:mRNA測序蛋白組學:蛋白鑒定代謝組學:代謝產物鑒定相互組學:以上各組相互作用表型組學:表現基因藥物組學:藥物基因
組學研究方法:基因組學:DNA測序轉錄組學:mRNA測序蛋白組學:蛋白鑒定
蛋白質組學流程
2Dgel電泳
Cy2Cy3Cy5三個螢光通道圖譜以及疊加後圖譜
Cy3和Cy5疊加圖
蛋白質組學流程
cDNA晶片檢測的原理
系統生物學(SystemsBiology)系統生物學是系統性地研究一個生物系統中所有組成成分(DNA、RNA、蛋白質等)的構成以及在特定條件下這些組分間的相互關係,並分析生物系統在一定時間內的動力學過程。
GenomeTranscriptomeProteomeCitricacidcycleMetabolome研究對象:各種生物分子的整合
系統生物學(SystemsBiology)
研究對象:各種層次的整合
SystemsBiology1,2,3,nGene(Protein)GenecloneGeneexpressionGenemutationProteinstructureProteininteraction研究策略:小科學與大科學的整合實驗生物科學(假設驅動的科學)組學(發現的科學)
研究策略:實驗科學與理論科學的整合系統生物學實驗科學分子生物學細胞生物學基因組學蛋白質組學······理論科學數學計算科學資訊科學理論物理學······
酵母的基因功能網路後基因組時代的生命觀:複雜系統
後基因組時代的生命觀:複雜系統
細胞信號轉導網路後基因組時代的生命觀:複雜系統
走向新的綜合小科學大科學系統生物學
傳統生物科學(中國傳統醫學)輸入輸出經典生物實驗科學輸入輸出A(基因/蛋白質)B(基因/蛋白質)系統生物學輸入輸出研究生命的新思維綜合性研究分析性研究分析+綜合研究
複雜疾病的系統生物學
21世紀生物醫學發展趨勢PredictivePreventivePersonalized(預測)(預防)(個體化)系統生物學
他莫昔芬與CYP2D6
(乳腺癌)應用舉例
治療前首先對CYP2D6的基因型進行檢測。在中國人群中,CYP2D6常見的功能減弱等位基因突變型為:CYP2D6﹡3(約占1%)CYP2D6﹡4(約占1%)CYP2D6﹡5(約占6%)CYP2D6﹡10(約占53%)此外,基因重複突變(geneuplication,約占2%)CYP2D6功能增強。應用舉例
他莫昔芬:雌激素受體拮抗劑/乳腺癌和卵巢癌CYP2D6:莫昔芬的主要代謝酶活化他莫昔芬CYP2D6基因型美國FDA,2006年,CYP2D6基因型檢測應用舉例
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