现代分子生物学-第三章.ppt

mRNA的共同特点是在高等生物中（酵母中无此特点）在poly（A）上游11-30nt处有一特殊序列AAUAAA，这一序列是高度保守的,对于初级转录产物的准确切割及加多聚（A）是必需的。真核生物mRNA中的加多聚A反应真核基因的3‘末端转录终止位点上游15～30bp处的保守序列AAUAAA对于初级转录产物的准确切割及加多聚(A)是必需的CPSF(cleavageandpolyadenylationspecificityfactor)CstF(cleavagestimulationfactor)增强子特点①具有远距离效应。②无方向性。③顺式调节。④无物种和基因的特异性，⑤具有组织的特异性。⑥有相位性。⑦有的增强子可以对外部信号产生反应。真核生物的启动子特点（1）有多种元件：TATA框，GC框，CATT框，OCT等；（2）结构不恒定。（3）它们的位置、序列、距离和方向都不完全相同;（4）有的有远距离的调控元件存在，如增强子；（5）这些元件常常起到控制转录效率和选择起始位点的作用；（6）不直接和RNAPol结合。转录时先和其它转录激活因子相结合，再和聚合酶结合。TATAboxHognessboxpromotergene-50-40-30-20-101105’CAATboxGCbox原核和真核生物基因转录起始位点上游区的结构比较不依赖于ρ因子的终止依赖于ρ因子的终止3.4终止和抗终止大肠杆菌中的两种终止子Rho非依赖型终止子的序列由两个序列原件组成：一段短的反向重复序列（大约20个核苷酸）;其后是一段大约8个A：T碱基对的序列。由它转录出mRNA可形成茎环结构，可阻止RNApol的前进。不依赖于ρ因子的终止子(固有终止子)茎的区域富内含G-C，使茎环不易解开；强终止子3′端上有4-6个U，由于它和模板形成的连续U-A配对较易打开，从而便于释放出RNA。Ecoli大约一半的基因含有内部终止子。终止效率与二重对称序列和寡聚U的长短有关，随着发卡式结构和寡聚U序列长度的增加，终止效率逐步提高。依赖于ρ因子的终止只含有自我互补区域，可形成茎环结构，但在茎中的G.C含量少，茎环易打开。其终止需要ρ因子的参与。ρ因子与ssRNA的特定位点结合(C丰富，G缺乏)。ρ通过催化NTP的水解促使新生RNA链从三元转录复合物中解离。ρ因子ρ因子是一个相对分子质量为2.0×105的六聚体蛋白。其功能是作为RNApol的一种辅助因子，当其浓度为RNApol浓度的10%时在体外可发挥最高的活性。ρ结合到RNA链终止子上游的某一点ρ因子结合以后延着RNA向3′端移动，跟踪聚合酶ρ追上在终止位点暂停的RNA聚合酶终止---三元复合物解体ρ因子参与的RNA合成终止模式“穷追”（hotpursuit）模型抗终止破坏终止位点RNA的茎－环结构依赖于蛋白质因子的转录抗终止破坏终止位点RNA的茎－环结构一些控制氨基酸合成的操纵子结构基因前有一段前导序列，带有终止信号并有串联的编码某一氨基酸的密码子;当介质中该氨基酸浓度较高时，与此相对应的氨酰基tRNA含量也高，核糖体能顺利通过串联密码子→mRNA能形成包括末端茎－环结构的正常二级结构，RNA聚合酶终止转录。当介质中该氨基酸浓度较高时，与此相对应的氨酰基tRNA含量高，核糖体顺利通过串联密码子，mRNA能形成包括末端茎－环结构的正常二级结构，RNA聚合酶终止转录。当该氨基酸浓度低时，相应氨酰基tRNA缺乏，核糖体滞留在串联密码子上，mRNA不能形成特定的二级结构，末端茎－环结构被破坏，出现转录抗终止现象。依赖于蛋白质因子的转录抗终止3.5原核与真核生物mRNA特征比较原核生物中，mRNA的转录和翻译不仅发生在同一个细胞空间里，而且这两个过程几乎是同步进行的。真核细胞的mRNA往往以较大分子量前体RNA出现在核内，只有成熟的、相对分子质量明显变小并经化学修饰的mRNA才能进入细胞质，参与蛋白质的合成。所以，真核细胞mRNA的合成和功能表达发生在不同的空间和时间范畴内。原核生物mRNA的特征半衰期短。许多原核生物mRNA以多顺反子的形式存在。原核生物mRNA的5’端无帽子结构，3’端没有或只有较短的多聚（A）结构。半衰期短原核生物中，mRNA的转录和翻译是在同一个细胞空间里同步进行的，蛋白质合成往往在mRNA刚开始转录时就被引发了。大多数细菌mRNA在转录开始1分钟后就开始降解。mRNA降解