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中文摘要
启膈方干预食管癌小鼠食管组织蛋白差异性表达的组学研究
摘要
食管癌(EC)是一种公认的恶性肿瘤,它的强侵袭性和低生存率给
患者带来了沉重的负担。近期研究表明,启膈方(QGF)对于抑制食管癌
的发展具有显著效果,鉴于目前的食管癌治疗所陷入的瓶颈,该疗法有望
成为一种新的治疗手段,为食管癌患者带来新的治疗选择。为了深入了解
食管癌的发病机制,研究人员采用了蛋白质组学的方法,如此可以揭示
管癌的分子机制,有助于识别潜在的治疗靶点。因此,蛋白质组学在当前
食管癌研究中已经引起了众多研究者们的关注。通过深入了解分子水平上
的变化,可以更好地理解食管癌的发展过程,并为未来的治疗策略提供有
力的支持。
目的:探讨QGF对食管癌小鼠食管组织蛋白质组学的影响,结合生
物信息学分析并发掘QGF抑制食管癌发生发展的潜在作用机制。
方法:
1.将45只C57BL/6小鼠(雌性,SPF级)采用随机分组的方式,
分为正常对照组(Control组,n=15),诱癌剂4-硝基喹啉-1-氧化物
(4NQO)诱导的原位食管癌模型组(4NQO组,n=15),以及同时使用
4NQO和中药启膈方组(4NQO+QGF组,n=15)。本实验中所有小鼠均
接受常规饲养。利用TMT同位素标记技术对各组小鼠食管组织蛋白进行
定量分析,对比并筛选出差异表达蛋白,进一步利用生物信息学分析深入
研究蛋白质组学的变化。
2.通过乳酸(LD)测试盒测量各组小鼠食管组织内乳酸产生的含量
变化。
3.用蛋白质免疫印迹法(WB)进一步验证部分差异蛋白在各组小
鼠食管组织中的表达情况。
结果:
1.利用定量蛋白质组学方法在小鼠食管组织中共鉴定到5909个蛋
白,44601条多肽。差异蛋白筛选标准为uniquepeptide大于或等于1;P
0.05;差异倍数(FC)1.2或0.83。与Control组相比,4NQO组检测
1
中文摘要
出差异表达蛋白数共为1493个,其中包含表达上调的蛋白为889个,表
达下调的蛋白604个;与4NQO+QGF组相比,4NQO组差异表达蛋白数
为2040个,其中上调蛋白1125个,下调蛋白915个。基因本体论(gene
ontology,GO)分析,鉴定到的蛋白主要分布在胞内(Intracellular)和细
胞器(organelle);发挥蛋白质结合(proteinbinding)和有机环化合物结
合(organiccycliccompoundbinding)等功能;主要参与细胞代谢过程
(Cellularmetabolicprocess)和有机物代谢过程(organicsubstance
metabolicprocess)等生物学过程。
2.KEGG分析主要涉及代谢途径,糖酵解/糖异生途径。进一步对显
著差异蛋白进行蛋白互相作用分析,各蛋白相互调控,构成以Polr2b、Eef2、
Rack1、Tpi1、Eno3、Alb和Ranbp2等为核心的蛋白相互作用网络,其中
Tpi1和ENO3为参与糖酵解途径的关键酶。
3.乳酸试剂盒检测结果提示QGF可以降低食管癌组织中的乳酸产
生。
4.蛋白质免疫印迹法结果提示QGF可以下调Tpi1和ENO3两个蛋
白的表达(P0.05),与蛋白质组学结果一致,表明蛋白质组学实验结果
可信。
结论:
1.在小鼠食管组织中共鉴定到5909个蛋白,44601条多肽。与Control
组相比,4NQO组差异表达蛋白数为1493个,其中上调蛋白889个,下
调蛋白604个;与4NQO+QGF组相比,4NQO组差异表达蛋白数为2040
个,其中上调蛋白1125个,下调蛋白915个。
2.QGF可能是通过下调Tpi1和ENO3两个蛋白表达抑制糖酵解代谢
途径进而抑制食管癌的发生发展。
关键词:食管癌,蛋白质组
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