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DCU驱动的蛋白质-分子对接算法并行训练与应用.pdf

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中文摘要

蛋白质通过与其他分子的相互作用发挥其生物学功能,为生命活动提供物质基

础。计算模拟的蛋白质与配体分子对接技术已成为研究这些相互作用的有效手段,在

蛋白质工程、药物设计、虚拟筛选等领域发挥着关键作用。DiffDock模型作为首个将

生成扩散模型理念应用于分子对接领域的算法,其速度和准确性均优于现有方法。然

而,由于其多轮迭代的特性及蛋白质与配体分子的生物数据复杂,该模型对计算资源

的需求极大,导致显存占用高、批量尺寸小、梯度震荡严重、训练耗时长等问题。因

此,本文聚焦于如何有效

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