遗传学第十三章基因工程与基因组学.pptVIP

果蝇连锁图明确显示遗传多态性的染色体结构特征和数量特征染色体的核型染色体的带型染色体的结构变异染色体的数目变异优点：不受环境影响缺点：数量少、费力、费时、对生物体的生长发育不利细胞学标记又称蛋白质标记就是利用蛋白质的多态性作为遗传标记。如：同工酶、贮藏蛋白优点：数量较多，受环境影响小缺点：受发育时间的影响、有组织特异性、只反映基因编码区的信息生化标记以DNA序列的多态性作为遗传标记不受时间和环境的限制遍布整个基因组，数量无限不影响性状表达自然存在的变异丰富，多态性好共显性，能鉴别纯合体和杂合体简称分子标记优点：DNA分子标记01（restrictionfragmentlengthpolymorphism，RFLP）02DNA序列能或不能被某一酶酶切，相当于一对等位基因的差异。03如有两个DNA分子（一对染色体），一个具有某一种酶的酶切位点，而另一个没有这个位点，酶切后形成的DNA片段长度就有差异，即多态性。04可将RFLP作为标记，定位在基因组中某一位置上。05人类基因组中有105个RFLP位点，每一位点只有两个等位基因。限制性片段长度多态性RFLP分析RFLP标记位共显性标记微卫星又称为简单重复序列（simplesequencerepeat，SSR）。这种重复序列的重复单位很短，常常只有2个、3个或4个核苷酸如一条染色体TCTGAGAGAGACGC另一染色体TCTGAGAGAGAGAGAGAGACGC，就构成了多态性。微卫星（microsatellite）标记理论基础:连锁与交换基本方法:两点测验法和三点测验法遗传图谱的构建方法43遗传标记检测标记间的连锁分析21选择研究材料（亲本）构建分离群体植物遗传图谱的构建要求亲缘关系远，遗传差异大但又不能相差太大以导致引起子代不育。对备选材料进行多态(差异)性检测，综合测定结果，选择有一定量多态性的一对或几对材料作为遗传作图亲本。020103选择亲本构建作图群体PART2利用遗传学方法或其它方法将少数标记锚定在染色体上，作为确定连锁群的参照系。常用的方法：单体分析三体分析代换系分析附加系分析遗传标记的染色体定位利用在两个亲本间有多态性的标记分析分离群体中所有个体的基因型01根据连锁交换的情况，确定标记之间的连锁关系和遗传距离02有计算机软件可以应用03标记间的连锁分析二、基因组学PART13基因组测序1基因组学概述4功能基因组学2基因组图谱的构建基因组学基因组（genome），又称染色体组一个物种单倍体的染色体数目，物种全部遗传信息的总和物种遗传信息的“总词典”控制发育的“总程序”生物进化历史的“总档案”1基因组学概述1986年提出，至今20年，已经发展成为遗传学中最重要的分支学科。对物种的所有基因进行定位、作图、测序和功能分析0102基因组学（genomics）5%55%30%10%获得生物体全部基因组序列明确基因之间的相互作用关系鉴定所有基因的功能阐明基因组的进化规律基因组学研究的最终目标在20世纪初，遗传学刚刚诞生的时候，遗传学家的工作主要是鉴别感兴趣的基因，确定这些基因在染色体上的位置。01第一个环节：寻找自发突变体，或者利用物理、化学因素诱发突变。02第二个环节：通过连锁分析确定新基因与已知基因的相互关系，绘制遗传连锁图。03经典遗传学几个代表物种的基因组大小FishinginaMoreEffectiveWay!Science,Vol291:1221.CREDIT:JOESUTLIFF结构基因组学功能基因组学蛋白质组学基因组学的研究内容结构基因组学（structuralgenomics）基因定位基因组作图测定核苷酸序列功能基因组学（functionalgenomics）又称后基因组学（postgenomics)基因的识别、鉴定、克隆基因结构、功能及其相互关系基因表达调控的研究蛋白质组学（proteomics）鉴定蛋白质的产生过程、结构、功能和相互作用方式2001年2月，公布人类基因组图谱的修订版1990，美国国立卫生研究所和能源部投资＄30亿，启动了人类基因组计划，预计15年时间完成人类基因组全部序列的测定2000，完成草图1996，完成标记密度为0.6cM的人类基因组遗传图谱，100kb的物理图谱2002，完成测序工作人类基因组计划基因组计划的主要任务是获得全基因组序列但是，现在的测序方法每次只能测800～1000bp大量的测序片段要拼接