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基因组图谱的构建在进行大规模序列测定之前,构建基因组图谱是测定大基因组全部核苷酸序列的重要一环。基因组图谱可作为序列测定中制定测序方案的依据,以便先重后轻地分析基因,锚定测知的核酸序列在染色体上的位置。因此,在人类基因组计划实施过程中,首先用了六年时间构建高密度的基因组图谱,然后才进入测序工作。遗传图谱图谱标记图谱构建中需要可以鉴别的标记(marker),在构建遗传图谱中,可用基因和DNA作为标记。基因标记:用基因作为标记,分析各基因间的连锁关系及遗传距离,绘制出连锁遗传图谱DNA标记:限制性内切酶多型性(RFLP)、简单序列长度多型性(SSLP)、单核苷酸多型性(SNPs)遗传图谱的构建人类基因组遗传图谱的构建:人类的遗传图谱是利用家系分析法,在对8个家系的134个成员的分析中,主要根据5264个STR标记绘制而成的。利用这些家系的资料绘制第1至22号染色体图谱。对于X染色体图谱,还利用了来自另外12个家系,170个成员的资料绘制而成。将5264个标记定位在2335个位点,据此构建的人类基因组遗传图谱的密度为每个标记599Kb。植物基因组遗传图谱的构建:选择亲本产生构图群体遗传标记的染色体定位标记间的连锁分析2、物理图谱2、物理图谱由于遗传图谱的分辨率有限、精确性不高,所以还要构建物理图谱。基因组物理图谱的构建主要有三种途径:①限制性酶图谱②荧光原位杂交技术(FISH)③序列标签位点(STS)如表达的序列标签(EST),来自cDNA图9-27酵母菌第III染色体遗传图谱(A)与物理图谱(B)的比较基因组序列测定基因定位基因组比较分析分子标记辅助选择基因的克隆与分离(二)基因组图谱的应用:后基因组学后基因组学(post-genomics)是在完成基因组图谱构建以及全部序列测定的基础上,进一步研究全基因组的基因功能、基因之间的相互关系和调控机制为主要内容的学科。后基因组学主要利用DNA微列阵技术、蛋白质组学、酵母菌双杂交系统以及生物信息学等技术相结合,对已知的基因组序列进行研究。010203021、DNA微列阵DNA微列阵(DNAmicroarrays)就是利用DNA芯片技术,同时进行大量分子杂交,以分析比较不同组织或器官的基因表达水平,筛选突变基因,从核酸水平分析基因表达模式。2、蛋白质组学蛋白质组学(proteomics)是从蛋白质水平来研究基因组的基因表达,分析基因组的蛋白质类型、数量、空间结构变异以及相互作用的机制。01酵母菌双杂交系统(twohybrid-systems)是利用在酵母菌的同一个细胞中共同表达不同蛋白质,以鉴定蛋白质之间互作的一种分析方法。3、酵母菌双杂交系统14、生物信息学生物信息学(bioinformatics)是利用计算机贮存原始资料,分析生物信息,将DNA芯片以及蛋白质双向电泳结果转变成为可读的遗传学信息的学科。生物信息学是将现代生物技术与计算机科学结合,收集、加工和处理生物资料。2图8?29酵母菌双杂交系统双杂交系统组成将A中的构建体混合,转化酵母菌自从1996年酵母菌基因组全序列测定以来,在4年多时间里,全世界已有1000多个实验室,5000多名科学家从事酵母菌后基因组学的研究,共发表论文7000多篇,鉴定1060个新基因的功能,但仍然还有约1600个阅读框架的功能不清楚。这些结果充分说明后基因组学研究的复杂性。水稻4.3?108人类3.3?109拟南芥1.0?107玉米5.4?109酵母1.5?107人类基因组计划(扩展课)
(humangenomeproject,HGP)人类基因组计划曼哈顿原子计划阿波罗登月计划NingxiaMedicalUniversityNingxiaMedicalUniversity*1基因A和B是两个不同基因,而B包含在基因A内。同样,基因E在基因D内2如基因D的终止密码子的最后一个碱基是J基因起始密码子的第一个碱基(如TAATG)基因的概念及作用A、基因的概念及其发展B、基因的作用及其调控C、基因组学基因的研究简史概述●19世纪60年代孟德尔提出遗传因子●1909年W.Johannsen首先使用基因(gene)一词●1926年Morgan发表了“基因论”●20世纪40年代Bendle和Tatum提出了“一个基因
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