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名词解释

生物信息学：狭义的生物信息学就是在生物科学的研究中，以计算机为工具对基因组信息进行贮存、检索和分析的科学。广义的生物信息学是包含生物信息的获取、处理、贮存、传递、分析和解释的所有方面的一门学科，它综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具进行研究，目的在于了解大量的生物学意义。

数据库技术：是一种计算机辅助管理数据的方法，它研究如何组织和存储数据，如何高效地获取和处理数据。是通过研究数据库的结构、存储、设计、管理以及应用的基本理论和实现方法，并利用这些理论来实现对数据库中的数据进行处理、分析和理解的技术。即：数据库技术是研究、管理和应用数据库的一门软件科学。

数据仓库：是数据集成的一种组织形式，它从各种数据资源中获得原始数据，先按辅助决策的主题要求形成当前基本数据层，再按综合决策的要求形成综合数据层。

EST：是从cDNA文库中生成的一些很短的序列，它们代表在特定组织或发育阶段表达的基因，有时可代表特定的cDNA。

概念性翻译：给定一个DNA，可以利用遗传密码将其翻译为蛋白质序列。

同源性：一般是指两种核算分子的核苷酸序列之间或两种蛋白质分子的氨基酸序列之间的相似程度。

单系类群：包含一个祖先类群所有子裔的群组称为单系类群，其成员间存在共同祖先关系。

全局排列：序列间的局部区域高度相似，这种情况下，使用局部排列就是在这些局部区域寻求最优的对位排列。

基因作图：是指对染色体和基因组进行分解，使之成为较易操作的小的结构区域，这个过程我们成为基因作图。

直系同源体簇：用不同种族的基因成对相似聚类法把它们划分成各种COG，可用同一簇已知基因注释未知基因。

填空题

生物信息学主要研究的两种信息载体是DNA分子和蛋白质分子。

国际上的三大核苷酸序列分别是EMBL、GenBank和DDBJ。

数据挖掘的三大技术支柱是数据库、人工智能和数理统计。

相同类型核苷酸的替换称为转换，不同类型核苷酸的替换称为颠换。

单项选择题

对模式生物进行全基因组的测定中，作为真菌模式生物的是C

A、大肠杆菌

B、青霉菌

C、酵母菌

D、线虫

NCBI成立于D

A、1988年

B、1989年

C、1990年

D、1992年

根据数据库管理系统所支持的基本数据模型的不同，可以将数据库分为五类，其中第二代数据库是C

A、层次数据库

B、网状数据库

C、关系数据库

D、分布式数据库

在向GenBank投送序列的工具中，D是标准的序列投送工具。

A、Cn3D

B、Tb12asn

C、BankIt

D、Sequin

目前最为常用和注释最全的蛋白质序列数据库是D

A、Identify

B、OWL

C、PIR

D、SWISS—PROT

下列选项中根据蛋白质三维折叠模式和进化关系划分的结构分类数据库是C

A、PDBsum

B、GDB

C、SCOP

D、CATH

构建系统发生树的方法很多其中耗时最短的是D

A、进化简约法

B、最大简约法

C、最大似然法

D、距离矩阵法的是

下列数据库选项中不属于蛋白质序列二次数据库的是D

A、PROSITE

B、PRINTS

C、BLOCKS

D、PDB

在系统发生树的检验中，较为常用的方法是B

A、MP法

B、重复取样法

C、NJ法

D、ML法

下列工具中用于发现开放阅读框的软件是B

A、TranslateTool

B、ORFFinder

C、GeneWise

D、E—PCR

多项选择题

生物大分子携带的三种信息是ABD

A、遗传信息

B、功能信息

C、调控信息

D、进化信息

为实现3个抽象级别间的数据转换，DBMS提供的两层映射是AC

A、外模式/概念模式映射

B、外模式/内模式映射

C、概念模式/内模式映射

D、概念模式/外模式映射

数据挖掘和知识发现一般可用于发现46页ABD和分类知识

A、广义知识

B、关联知识

C、聚类知识

D、预测性知识

用于检测DNA序列中潜在的CDS的几种特征是ABC

A、ORF长度

B、Koxzak序列

C、密码子用法

D、密码子使用偏性

下列数据库选项中属于蛋白质结构二次数据库的是AC

A、DSSP

B、FSSP

C、Profiles

D、HSSP

下列选项中属于整合生物信息学数据系统AB

A、SRS

B、Entrez

C、Genera

D、FLYBASE

公用的EST的分析工具有ACD

A、序列相似性查询

B、序列分类

C、序列组装

D、序列聚类

根据有无外类群，可以将系统树分为AB

A、有根树

B、无根树

C、基因树

D、标度树

在构建系统发生树的软件包中，基于最大似然法的构树软件包是C

A、MOLPHY软件包

B、TreeView软件包

C、PAML软件包

D、PUZZLE软件包

双向凝胶电泳技术的双向是指BD

A、正向