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842JDiagnTherDermato-Venereol,December.2024.Vol.31,No.12
论著
基于生物信息学探讨类泛素化修饰在银屑病
中的作用机制并药物敏感性分析
袁立燕,余晓玲,何雪瑜
南方医科大学皮肤病医院,广东广州510091
【摘要]目的使用生物信息学方法探讨泛素样修饰蛋白(SUMO)在银屑病中的表达与调控机制,分
析其对银屑病代谢相关的影响。方法通过R语言(3.3.6)绘制SUMO在银屑病和对照组中的差异
表达及接收者操作特征曲线(ROC),利用GeneMANIA网站构建SUMO的相互作用网络,采用网络基因
富集分析软件(GSVA)展示SUMO在银屑病数据集中的富集通路,采用XGBOOST和随机森林筛选优
势基因并在数据集中进行差异表达的验证,使用pRRophetic[R4.2.0]在银屑病数据集寻找可能靶向
SUMO的药物。结果SUMO1、SUMO3、SUMOIP3、SUMO2P3在银屑病皮损中高表达,SUMO在银屑病
中与多个代谢通路相互作用,其中SUMOI可证实为与代谢通路相关性最为密切的基因。结论SUMO
mRNA在银屑病皮损中高表达,SUMO1可能通过调控银屑病代谢过程参与银屑病发生发展。
[关键词]银屑病;类泛素化修饰;SUMO;代谢
Usingbioinformaticstorevealthepathogenicmechanismsofsmallubiquitin-likemodifica-
tioninpsoriasisandtopredictdrugsensitivity
YUANLiyan,YUXiaoling,HEXueyu
DermatologyHospital,SouthernMedicalUniversity,Guangzhou510091,China
ron.ornn.(L.24@163.com
Corresr
ObjectiveUsingbioinformaticstoassesstheexpressionlevelsandregulatory
[Abstract](
mechanismsofsmallubiquitin-relatedmodifier(SUMO)inpsoriasis,andtoanalyzeitseffecton
metabolism.MethodsRlanguage(3.3.6version)wasusedtodeterminethedifferenceinex-
pressionlevelsofSUMObetweenpsoriaticpatientsandcontrols,andthereceiveroperatingchar-
acteristic(ROC)curveofSUMO.TheinteractionnetworkofSUMOwasbuiltusingthewebsiteof
GeneMANIA.ThenetworkgeneenrichmentanalysissoftwareGSVAwasusedtodeterminetheen-
richmentpathwayofSUMOinthepsoriasisdataset.XGBOOSTandrandomforestwereusedto
screendominantgenesandverifytheirdifferentialexpression.pRRopheticwasusedtoidentifypo-
tentialdrugstargetingSUMOinthepsoriasisdataset.ResultsSUMO1,SUM03,SUMO1P3,
SUMO2P3werehighlyexpressedinpsoriasis-involvedskin.SUMOinteractedwithmultip
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