2025年高通量测序：环境微生物群落多样性分析.doc

(5)高通量测序：环境微生物群落多样性分析

微生物群落多样性的基本概念

环境中微生物的群落构造及多样性和微生物的功能及代謝机理是微生物生态學的研究热點。長期以来，由于受到技术限制，對微生物群落构造和多样性的认识還不全面，對微生物功能及代謝机理方面理解的也很少。但伴随高通量测序、基因芯片等新技术的不停更新，微生物分子生态學的研究措施和研究途径也在不停变化。第二代高通量测序技术（尤其是Roche

454高通量测序技术）的成熟和普及，使我們可以對环境微生物進行深度测序，敏捷地探测出环境微生物群落构造随外界环境的变化而发生的极其微弱的变化，對于我們研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源的运用以及人类醫疗健康有著重要的理论和現实意义。

在国内，微生物多样性的研究波及农业、土壤、林业、海洋、矿井、人体醫學等诸多领域。以在醫疗领域的应用為例，通過比较正常和疾病状态下或疾病不一样進程中人体微生物群落的构造和功能变化，可以對正常人群与某些疾病患者体内的微生物群体多样性進行比较分析，研究获得人体微生物群落变化同疾病之间的关系；通過深度测序還可以迅速地发現和检测常見病原及新发传染病病原微生物。研究措施進展

环境微生物多样性的研究措施诸多，從国内外目前采用的措施来看大体上包括如下四类：老式的微生物平板纯培养措施、微平板分析措施、磷脂脂肪酸法以及分子生物學措施等等。

近几年，伴随分子生物學的发