生物信息的传递（上）课件.ppt

分子生物学_3内在终止子的特点：1.终止位点上游一般存在一段富含GC碱基的二重对称区，其转录生成的mRNA容易互补形成的发卡式结构。2.终止位点上游一般有4～8个A组成的序列，转录生成的mRNA的3′末端中相应的有一连串U序列。分子生物学_33.5.2依赖于ρ因子的终止有些终止点的DNA序列缺乏共性，不能诱导转录的自发终止，需要ρ因子的参与。ρ因子：6聚体NTP酶活性解旋酶活性分子生物学_3“穷追(hotpursuit)”模型分子生物学_3分子生物学_33.5.3抗终止由于不同生理要求，转录过程中有时即使遇到终止信号，仍需要继续转录的现象。分子生物学_31破坏终止位点RNA的茎-环结构当介质中某一氨基酸的浓度较低时，缺乏相应氨酰-tRNA，将致使核糖体滞留在串联密码子上，mRNA不能形成特定的二级结构，末端茎-环结构被破坏，因此转录仍将继续进行，出现抗终止现象。例子：色氨酸操纵子分子生物学_3终止构型抗终止构型分子生物学_32依赖于蛋白质因子的转录抗终止分子生物学_33.6内含子的剪接、编辑、再编码和化学修饰转录作用产生出的mRNA、tRNA及rRNA的初级转录本全是前体RNA或核不均一RNA，要经过剪接、编辑、再编码及化学修饰等加工过程才能变成有活性的RNA分子。RNA的加工过程主要是在细胞核内进行，也有少数反应是在胞质中进行。分子生物学_33.6.1RNA中的内含子真核生物的基因往往是断裂的基因，其转录所形成的RNA前体要经过剪切，将内含子切除后，将外显子拼接起来才能形成成熟的mRNA。真核基因平均含8～10个内含子，前体分子一般比成熟mRNA大4～10倍。分子生物学_3分子生物学_3内含子两端边界存在共有序列：（GU-AG法则）在内含子内部部分序列也可能参与内含子的剪接，他们可能是pre-mRNA剪接过程中各种核糖核蛋白剪接调节因子的结合位点。3’上游18-50个核苷酸处：Py80NPy87Pu75A100Py95分子生物学_3分子生物学_3分子生物学_33.6.2mRNA的剪接许多相对分子质量较小（长约106-185nt）的核内RNA（如U1，U2，U4，U5和U6）以及与这些RNA相结合的核蛋白(snRNP)参与RNA的剪接。AG前一位核苷酸可以影响剪切效率：CAG=UAGAAGGAG如果mRNA前体上同时存在几个AG，可能发生剪接竞争。剪接前体剪接体分子生物学_3分子生物学_3E.colipromoters分子生物学_3原核启动子的共有序列和共有间距分子生物学_33.3.2启动子区的识别启动子的功能既受DNA序列的影响，又受其构象的影响，推测RNA聚合酶并不直接识别碱基本身，而是通过氢键互补的方式加以识别。（类似于酶与底物的结合）RNApolymeraseIIpre-initiationcomplexmodel分子生物学_3分子生物学_3分子生物学_33.3.3RNA聚合酶与启动子区的结合真核原核分子生物学_3RNApolymerasepassesthroughseveralstepspriortoelongationAdaptedfromS.P.Haugen,W.Ross,andR.L.Gourse,Nat.Rev.Microbiol.6(2008):507-519.分子生物学_3扩展：RNApolymerase(pol)IIundergoesacycleofphosphorylationanddephosphorylationattheC-terminaldomain(CTD)duringtranscriptioninitiation,elongationandtermination.Initialpromoterrecognitionandpre-initiation-complexformationoccurswithanunphosphorylatedCTD.Followingtranscriptioninitiation,theCTDisphosphorylatedonSer5bythetranscriptionfactorTFIIH,afterwhichthepolymeraseoftenpauses.TranscriptionalelongationisstimulatedbyP-TE