医学代谢组学技术与研究系列讲座05代谢组学基础知识介绍及样品准备.pptx

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解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金谢组学介绍动物及临床样品的准备常用代谢组学技术与策略代谢组学基础分析方法CONTENTS课程目录

代谢组学介绍01

知识金牌系统生物学与经典分子生物学系统生物学VS 经典分子生物学广，高通量、大数据精，低通量，很准确解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌不同组学在系统生物学中的定位生物信息学蛋白组学核酸组学代谢组学核酸组学：从底层原因层面探究和解决生物学问题。蛋白组学：从表层原因层面探究和解决生物学问题。解螺旋|陪伴医生科研成长代谢组学：从分子性状及结果层面探究和解决生物学问题。多层组学整合：组学发展的新趋势，结果更可靠、数据更丰富。

知识金牌不同组学在系统生物学中的定位DNARNAProteinMetabolitePhenotype基因组转录组蛋白组代谢组激素，修饰基团，有机酸…解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌 代谢组(Metabolome)：参与新陈代谢、维持生物体正常生长功能和生长发育的所有内源小分子，尤其指分子质量为1,000以下的小分子物质，如：氨基酸、肽、碳水化合物、脂类、核酸 …… 代谢组学(Metabolomics)：研究生物体系(细胞、组织或生物体)受刺激或扰动后代谢组的变化的科学。解螺旋|陪伴医生科研成长代谢组既是研究的领域和方向，也是研究的工具和策略代谢组学定义

知识金牌Metabolomics通过定性和定量地分析生物体内所有代谢物组成来研究生物代谢途径的一种技术，最早使用GC-MS技术为主。（Fiehn）Metabonomics生物体在病理生理刺激或基因修饰下其所有代谢物质在不同时间的动态变化规律，最早使用NMR技术为主。（Nicholson）现阶段以Metabonomics为统一名称，分析技术也涵盖NMR、GC-MS、LC-MS等。解螺旋|陪伴医生科研成长代谢组学定义

知识金牌代谢组学研究特点解螺旋|陪伴医生科研成长优势：? 基因和蛋白表达的有效的微小变化会在代谢物上得到放大，从而使检测更容易。 因为代谢产物在各个生物体系中都是类似的，所以代谢组学研究中采用的技术更通用，一般不需要针对专门物种建立大规模数据库。分析快速，能满足大样本和快速筛选的需求。 代谢组学反映的是各因素综合作用下的终末效应，是各个因素效应的综合体现，具有很强的综合信息优势。 很多内源性小分子化合物的生化代谢网络已经比较清楚，而且代谢产物早已作为标志物用于临床评估，对于后续标志物开发有天然优势。

知识金牌代谢组学研究特点解螺旋|陪伴医生科研成长难点：?代谢物浓度的动态范围较宽，对于多种代谢物同时实现准确定量比较困难。代谢物复杂程度较高，不同的修饰甚至不同的构型在生物功能都有差别，基于常规的质谱技术比较难区分。基于数据库信息以及质谱灵敏度等原因，很难实现高通量全范围准确检测（能分离出几千上万个质谱峰，但只能解析出几百上千个代谢产物，定性率在10-20%左右）。

知识金牌发展历程尿液代谢轮廓MS分析代谢轮廓1970年左右：M.G.Homing1982年：V.D.Greef1997年：OliverFiehn血浆NMR分析解螺旋|陪伴医生科研成长1983年：SadlerBuckinghamNicholson提出Metabolome概念

知识金病早期诊断发病机制分析药效分析药物毒理学代谢组学应用范围解螺旋|陪伴医生科研成长

知识金牌代谢组学研究现状233331769514317827343350245449464784211381186165019612384257905001000150020002500300020082009201020112014201520162017代谢组学研究论文年度递增表2012 2013中国 世界时间：2018年1月1日数据库：NCBI-Pubmed词 汇：metabolome,metabolomic,metabolomics位置：Title/Abstract-Completion解螺旋|陪伴医生科研成长

| 陪伴医生科研成长知识金牌样品采集/预处理代谢物提取数据采集与信息识别GC-MS气相质谱LC-MS液相质谱NMR核磁代谢组技术平台PCA分析PLS-DA分析Pathway分析解螺旋Cluster分析代谢组学基本流程

动物及临床样品