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单细胞空间转录组培训考核试题（附答案）

一、单选题（每题2分，共30分）

1.以下哪种技术不属于单细胞转录组测序技术？

A.SMART-seq2

B.10xGenomicsChromium

C.RNA-seq

D.Drop-seq

答案：C

2.单细胞空间转录组技术能够同时获得细胞的：

A.基因表达信息和形态信息

B.基因表达信息和空间位置信息

C.蛋白质表达信息和空间位置信息

D.代谢物信息和空间位置信息

答案：B

3.在单细胞空间转录组数据中，“spot”通常代表：

A.单个细胞

B.一群细胞

C.一个基因

D.一个转录本

答案：B

4.以下哪个软件常用于单细胞空间转录组数据的可视化？

A.DESeq2

B.Seurat

C.limma

D.edgeR

答案：B

5.单细胞空间转录组实验中，组织切片的厚度一般为：

A.1-2μm

B.5-10μm

C.20-30μm

D.50-100μm

答案：B

6.空间转录组数据的归一化方法不包括：

A.TPM归一化

B.FPKM归一化

C.批次效应校正归一化

D.分位数归一化

答案：C

7.在单细胞空间转录组分析中，聚类分析的目的是：

A.找出差异表达基因

B.识别具有相似基因表达模式的细胞群体

C.确定细胞的空间位置

D.分析基因的功能富集

答案：B

8.以下哪种标记物常用于识别空间转录组切片中的不同细胞类型？

A.管家基因

B.细胞特异性标记基因

C.转录因子基因

D.线粒体基因

答案：B

9.单细胞空间转录组技术中，原位捕获mRNA的方法是：

A.通过带有寡聚dT的探针

B.通过随机引物

C.通过PCR扩增

D.通过RNA杂交

答案：A

10.对于空间转录组数据，以下哪种降维方法最常用？

A.PCA（主成分分析）

B.ICA（独立成分分析）

C.t-SNE

D.UMAP

答案：A

11.在分析空间转录组数据时，用于检测基因共表达模块的算法是：

A.WGCNA

B.Monocle

C.Scanpy

D.CellRank

答案：A

12.单细胞空间转录组实验中，防止RNA降解的关键步骤是：

A.组织固定

B.切片制备

C.mRNA捕获

D.文库构建

答案：A

13.以下哪个数据库可用于查询空间转录组相关的研究数据？

A.GEO

B.KEGG

C.Reactome

D.UniProt

答案：A

14.空间转录组数据中，基因表达的可视化可以使用的图不包括：

A.散点图

B.热图

C.火山图

D.小提琴图

答案：D

15.单细胞空间转录组技术对于研究肿瘤微环境的重要意义在于：

A.揭示肿瘤细胞的基因突变情况

B.确定肿瘤细胞的起源

C.分析肿瘤细胞与周围细胞的空间关系和相互作用

D.评估肿瘤的化疗效果

答案：C

二、多选题（每题3分，共30分）

1.单细胞空间转录组技术的应用领域包括：

A.发育生物学

B.神经科学

C.肿瘤学

D.免疫学

答案：ABCD

2.以下属于单细胞空间转录组技术优点的有：

A.能够保留细胞的空间信息

B.可以检测低丰度转录本

C.可以同时分析大量细胞

D.可以准确鉴定细胞类型

答案：ABCD

3.在单细胞空间转录组数据处理中，质量控制的指标包括：

A.每个spot的基因数

B.线粒体基因比例

C.核糖体基因比例

D.每个spot的转录本数

答案：ABCD

4.常用的单细胞空间转录组数据分析流程包括：

A.数据预处理

B.聚类分析

C.差异表达分析

D.空间模式分析

答案：ABCD

5.以下哪些方法可用于单细胞空间转录组数据的细胞类型注释？

A.基于已知标记基因的注释

B.基于参考数据集的注释

C.基于机器学习算法的注释

D.基于基因调控网络的注释

答案：ABC

6.空间转录组实验中，可能影响数据质量的因素有：

A.组织保存条件

B.切片厚度

C.探针特异性

D.文库构建过程中的PCR扩增效率

答案：ABCD

7.在分析单细胞空间转录组数据时，可用于识别细胞间相互作用的方法有：

A.配体-受体分析

B.基因共表达分析

C.空间邻近分析

D.功能富集分析

答案：ABC

8.单细胞空间转录组技术与传统转录组技术相比，其独特之处在于：

A.能够检测单个细胞的转录组

B.能够保留细胞的空间位置信息

C.可以分析细胞间的相互作用

D.可以检测更多的基因

答案：ABC

9.对于空间转录组数据的可视化，常用的工具和方法有：

A.Seurat的Fea