《人体肠道微生物16S rDNA 高通量测序方法》.docxVIP

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CCS

FORMTEXTA40

FORMTEXT3502

FORMTEXT福建省厦门市地方标准

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FORMTEXT人体肠道微生物16SrDNA

高通量测序方法

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High-throughputsequencingmethod

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FORMTEXT2025-FORMTEXTXX-FORMTEXTXX发布

FORMTEXT2025-FORMTEXTXX-FORMTEXTXX实施

FORMTEXT厦门市市场监督管理局??发布

STYLEREF标准文件_文件编号DB3502/TXXXX—XXXX

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STYLEREF标准文件_文件编号DB3502/TXXXX—XXXX

目次

TOC\o1-1\h前言 II

1范围 1

2规范性引用文件 1

3术语和定义 1

4缩略语 2

5检测条件 2

6样本采集、运输与保存 2

7样本的接收与处理 3

8检测步骤 3

9测序 4

参考文献 6

前言

本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定起草。

请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。

本文件由厦门市科学技术局提出并归口。

本文件起草单位：厦门承葛生物科技有限公司、厦门市食品药品审评认证与不良反应监测中心、厦门承葛医学检验实验室有限公司、厦门市标准化研究院。

本文件主要起草人：何剑全、肖传兴、许艳稚、林爱强、梁银龙、张帮周、张金梅、陈鑫、吴水金、曹曼、陈瑀、甘煌灿。

人体肠道微生物16SrDNA检测

高通量测序方法

范围

本文件规定了采用高通量测序方法进行人体肠道微生物16SrDNA检测的检测条件、检测试剂、检测仪器设备、样本采集、运输与保存、样本接受与处理。

本文件适用于运用16SrDNA高通量测序法进行人体肠道微生物中细菌的检测，亦可应用于其他动物肠道微生物中细菌的检测。

规范性引用文件

下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中，注日期的引用文件，仅该日期对应的版本适用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。

GB19489实验室生物安全通用要求

GB/T6682—2008分析实验室用水规格和试验方法

GB/T39767—2021人类生物样本管理规范

GB/T19495.3转基因产品检测核酸提取纯化方法

GB/T19495.4转基因产品检测实时荧光定性聚合酶链式反应（PCR）检测方法

GB/T40974核酸样本质量评价方法

GB/T40226—2021环境微生物宏基因组检测高通量测序法

术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。

16SrDNA

细菌染色体上编码核糖体RNA亚基的一个基因，存在于所有细菌的基因组中。

高通量测序high-throughputsequencing

能够一次并行对大量核酸分子进行平行序列测定的技术,通常一次测序反应能产生不低于100Mb碱基对的测序数据。

[来源:GB/T30989—2014,3.19，有修改]

引物primer

在DNA复制过程中，结合于模板链上并作为复制延伸的起始位点和/或终止位点的，具有一定长度和顺序的寡核苷酸链。

[来源:GB/T30989—2014,3.11]

扩增子amplicon

DNA或RNA扩增后形成的一段核苷酸序列。

文库library

通过生物来源的、人工合成的或克隆技术等所得到的一个重建分子群,如基因组文库、互补DNA文库、噬菌体展示肽文库等。

[来源:GB/T30989—2014,3.5]

可操作分类单元operationaltaxonomyunit，OTU

具有特定功能特征或特定基因组特征的物种的集合。

可以指生物分类学意义上的种，也可以指科、属等物种分类单元。

相对丰度relativeabundance

某一特定种类微生物在环境总微生物群落中所占的相对比例，通常以百分比表示。

某OTU的相对丰度是样