第26章组学与医学.ppt

三、蛋白质相互作用研究是认识蛋白质功能的重要内容蛋白质-蛋白质相互作用是维持细胞生命活动的基本方式。研究蛋白质相互作用常用的方法有酵母双杂交、亲和层析、免疫共沉淀、蛋白质交联、荧光共振能量转移（FRET）等。第30页，共51页，星期日，2025年，2月5日第四节代谢组学Metabonomics第31页，共51页，星期日，2025年，2月5日代谢组学（metabonomics）就是测定一个生物/细胞中所有的小分子（Mr?1000d）组成，描绘其动态变化规律，建立系统代谢图谱，并确定这些变化与生物过程的联系。第32页，共51页，星期日，2025年，2月5日一、代谢组学的任务是分析生物/细胞代谢产物的全貌代谢组学分为四个层次：①代谢物靶标分析：对某个或某几个特定组分的分析；②代谢谱分析：对一系列预先设定的目标代谢物进行定量分析；③代谢组学：对某一生物或细胞所有代谢物进行定性和定量分析；④代谢指纹分析：不分离鉴定具体单一组分，而是对代谢物整体进行高通量的定性分析。第33页，共51页，星期日，2025年，2月5日代谢组学主要以生物体液为研究对象，如血样、尿样等，另外还可采用完整的组织样品、组织提取液或细胞培养液等进行研究。第34页，共51页，星期日，2025年，2月5日二、核磁共振、色谱及质谱是代谢组学的主要分析工具①NMR：是当前代谢组学研究中的主要技术。代谢组学中常用的NMR谱是氢谱（1H-NMR）、碳谱（13C-NMR）及磷谱（31P-NMR）；②MS：按质荷比（m/z）进行各种代谢物的定性或定量分析，可得到相应的代谢产物谱；③色谱-质谱联用技术：这种联用技术使样品的分离、定性、定量一次完成，具有较高的灵敏度和选择性。目前常用的联用技术包括气相色谱-质谱联用（GC-MS）和液相色谱-质谱联用（LC-MS）。第35页，共51页，星期日，2025年，2月5日代谢组学研究的技术系统及手段第36页，共51页，星期日，2025年，2月5日目录第1页，共51页，星期日，2025年，2月5日第二十六章组学与医学-omicsandMedicine第2页，共51页，星期日，2025年，2月5日第3页，共51页，星期日，2025年，2月5日第一节

基因组学

Genomics第4页，共51页，星期日，2025年，2月5日基因组(genome)一个细胞（或病毒）所载的全部遗传信息，它代表了一种生物所具有的全部遗传信息。对真核生物体而言，基因组是指一套完整单倍体DNA（染色体DNA）及线粒体或叶绿体DNA的全部序列，既有编码序列，也有大量存在的非编码序列。第5页，共51页，星期日，2025年，2月5日基因组学(genomics)是阐明整个基因组的结构、结构与功能关系以及基因之间相互作用的科学。一、基因组学包含结构基因组学、功能基因组学和比较基因组学第6页，共51页，星期日，2025年，2月5日基因组学包括3个不同的亚领域结构基因组学(structuralgenomics)功能基因组学(functionalgenomics)比较基因组学(comparativegenomics)基因组学概念第7页，共51页，星期日，2025年，2月5日二、结构基因组学的主要任务是基因组作图和大规模测序结构基因组学(structuralgenomics)是通过HGP的实施来完成的。HGP的内容就是制作高分辨率的人类遗传图和物理图，最终完成人类和其它重要模式生物全部基因组DNA序列测定，因此HGP属于结构基因组学范畴。第8页，共51页，星期日，2025年，2月5日（一）遗传作图和物理作图是绘制人类基因组草图的重要策略1．遗传作图就是绘制连锁图遗传图（geneticmap）又称连锁图（linkagemap）。遗传作图（geneticmapping）就是确定连锁的遗传标志位点在一条染色体上的排列顺序以及它们之间的相对遗传距离，用厘摩尔根（centi-Morgan，cM）表示，当两个遗传标记之间的重组值为1%时，图距即为1cM。（1）限制性片段长度多态性（RFLP）（2）可变数目串联重复序列（VNTR）（3）单核苷酸多态性（SNP）第9页，共51页，星期日，2025年，2月5日2．物理作图就是描绘杂交图、限制性酶切图及克隆系图物理作图包括：①荧光原位杂交图（fluorescentinsituhybridizationmap，FISHmap）：将荧光标记的探针与染色体杂交确定分子标记所在的位置；②限制性酶切图（