DB12T 647-2016 大白菜品种纯度SSR分子标记检测方法.docxVIP

ICS67.050

B31DB12

天津市地方标准

DB12/T647—2016

大白菜品种纯度SSR分子标记检测方法

MethodsofidentifyingvarietalpurityofChinesecabbagebyusingSSR-basedmarkers

2016-09-27发布2016-11-01实施

天津市市场和质量监督管理委员会发布

I

DB12/T647—2016

前言

本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。

本标准由天津市农村工作委员会提出。

本标准起草单位：天津市农业质量标准与检测技术研究所、天津市蔬菜研究中心。

本标准主要起草人：赵新、王超楠、兰青阔、王成、刘莉莉、朱珠、李梅、陈锐、徐石勇。

本标准2016年9月首次发布。

DB12/T647—2016

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大白菜品种纯度SSR分子标记检测方法

1范围

本标准规定了大白菜品种纯度SSR分子标记检测方法的术语和定义、检测方法、纯度计算方法。本标准适用于大白菜单交种的纯度检测。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。

GB/T3543.2农作物种子检验规程扦样

GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。

3.1

品种纯度varietiespurity

品种纯度指种子在SSR分子标记带型方面典型一致的程度，用具有本品种特异带型的种子粒数占检测样品种子粒数的百分率表示，以反映某品种特征特性的一致性程度。

3.2

聚合酶链式反应polymerasechainreaction（PCR）

一种在体外通过酶促反应扩增特异DNA片段的技术。

3.3

简单重复序列simplesequencerepeat（SSR）

由几个核苷酸（1-6个）为重复单位聚集而成的长达几十个至几百个bp（一般为100-200bp）的串联重复序列，又称微卫星序列或短串联重复序列，其高度多态性主要来源于串联数目的不同。

3.4

分子标记molecularmarker

以蛋白质、核酸分子的多态性为基础，检测生物在遗传上的差异。

4原理

SSR分布于大白菜整个基因组，每个位点上重复单位的数目不同造成了品种间的多态性，利用PCR技术将多态的SSR扩增出来，通过电泳检测扩增产物，利用电泳图谱进行大白菜品种纯度检测。

DB12/T647—2016

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5仪器设备及试剂

5.1仪器设备

PCR仪；测序电泳槽；水平电泳槽；高压电泳仪（3000V，400mA，400W）；万分之一电子天平；微量加样器；磁力搅拌器；台式离心机；紫外-可见成像系统；胶片观察灯；水平摇床；高压灭菌锅；pH计等。

5.2试剂

乙二胺四乙酸二钠（EDTA-Na2）；三羟甲基氨基甲烷（Tris）；盐酸（HCl，36%）；十二烷基硫酸钠（SDS）；氯化钠（NaCl）；氢氧化钠（NaOH）；硼酸；去离子甲酰胺；溴酚蓝；二甲苯青FF；甲叉双丙烯酰胺；丙烯酰胺；尿素；亲和硅烷；剥离硅烷；无水乙醇；四甲基乙二胺（TEMED）；过硫酸铵；冰醋酸；硝酸银；甲醛溶液（37%）；TaqDNA聚合酶（含Mg2+的10×PCR缓冲液）；四种脱氧核糖核苷酸（dNTPs）；SSR引物；琼脂糖；GoldView染料；实验用水为重蒸馏水或符合GB/T6682规定的一级水等。除特殊说明外，所用试剂均为分析纯试剂。

5.3溶液配制

相关溶液配制方法见附录A。

6方法步骤

6.1取样

按照GB/T3543.2规定方法扦样，从送检样品中随机取10g种子，分别随机取其亲本种子10粒。

6.2单粒种子的DNA提取

6.2.1样品预处理

在玻璃培养皿底部垫上一层厚度适宜的棉花，用自来水浸湿后均匀地撒上种子，再于表面覆盖一层纱布，置于光照培养箱中。培养条件为16小时35℃光照培养，8小时28℃暗培养，待种子长出子叶后备用。也可采用经验证的、等效的培养条件。

6.2.2DNA提取

取