2个候选lncRNA的克隆、序列分析及其在奶牛乳腺上皮细胞炎症反应中的表达.pdfVIP

西南农业学报2023年36卷11期

2518SouthwestChinaJournalofAgriculturalSciencesVol.36No.11

引用格式：

董益闻,罗仍卓么，王兴平，王晋鹏，周力．2个候选IncRNA的克隆、序列分析及其在奶牛乳腺上皮细胞炎症反应中的表达[J]．西南农业学报，

2023,36(11):2518-2526.

DongYW,LuorengZM,WangXP,WangJP,ZhouL.CloningandsequenceanalysisoftwocandidatelncRNAsandtheirexpressioninbovinemam-

maryepithelialcellwithinflammation[J].SouthwestChinaJournalofAgriculturalSciences,2023,36(11):2518-2526.D0I:10.16213/j.cnki.scjas.

2023.11.024.

2个候选lncRNA的克隆、序列分析

及其在奶牛乳腺上皮细胞炎症反应中的表达

董益闻2,罗仍卓么-2,王兴平1-2，王晋鹏-2，周力12

（1.宁夏大学动物科技学院，银川750021;2．宁夏回族自治区反台动物分子细胞育种重点实验室，银川750021）

摘要：【目的】探究2个候选lncRNA(lncRNATCONS-72171和lncRNATCONS-62349）在奶牛乳腺上皮细胞炎症模型中的表达与

功能分析。【方法】利用基因克隆和测序技术验证候选lncRNA的真实性；并进行候选lncRNA序列同源性、亚细胞定位、靶基因预

测及KEGG信号通路分析。此外，利用脂多糖（Lipopolysaccharide,LPS）诱导奶牛乳腺上皮细胞产生炎症反应；采用RT-qPCR技术

检测LPS诱导0.3、6和12h的奶牛乳腺上皮细胞内上述2个候选lncRNAs的表达情况。【结果】奶牛IncRNATCONS-72717和In-

cRNATCONS-62349真实存在，且在部分物种间高度保守；上述2个IncRNA在LPS诱导的奶牛乳腺上皮细胞中表达均呈极显著上

调（P0.01），且分别主要位于细胞质与细胞核。靶基因预测与KEGG信号通路分析预测结果显示，上述2个lncRNA的潜在靶基

因（LCP2、ALOX12和ASGR1等）可能通过JAK-STAT、NF-kB和MAPK等炎症相关的信号通路而发挥调控细胞炎症的作用。【结

论】表达上调的IncRNATCONS-72171和IncRNATCONS-62349可能在LPS诱导的奶牛乳腺上皮细胞炎症中发挥重要的调控作用，

该结果可为深入研究奶牛乳腺炎分子调节机制奠定基础。

关键词：奶牛lncRNA；乳腺炎；乳腺上皮细胞；生物信息学分析

中图分类号：S823.8文献标识码：A文章编号：1001-4829(2023)11-2518-09

CloningandsequenceanalysisoftwocandidateIncRNAsandtheir

expressioninbovinemammaryepithelialcellwithinflammation

DONGYi-wen2,LUORENZhuo-mal-2,WANCXing-ping*,

WANGJin~-peng2,ZHOULil.2

(1.CollegeofAnimalScience,NingxiaUniversity,Yinchuan750021,China;2.KeyLaboratoryof