生物信息学:蛋白质结构预测_(7).基于同源建模的蛋白质结构预测.docx

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基于同源建模的蛋白质结构预测

1.同源建模概述

同源建模(HomologyModeling)是一种广泛应用于蛋白质结构预测的方法,其基本原理是利用已知的蛋白质三维结构来推断与其序列相似的未知蛋白质的三维结构。这种方法基于蛋白质序列和结构之间的关系,即具有高相似度的氨基酸序列往往对应于相似的三维结构。同源建模在生物信息学中具有重要的应用,尤其是在缺乏实验数据或实验数据难以获得的情况下,能够提供可靠的蛋白质结构模型,从而帮助研究者进行进一步的功能分析和药物设计。

1.1同源建模的基本步骤

同源建模通常包括以下几个步骤:

序列比对:将目标蛋白质序列与已知

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