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ASmall-MoleculeProtein–ProteinInteractionInhibitorof
PARP1ThatTargetsItsBRCTDomain
文献信息
刊名:AngewandteChemie(InternationalEditioninEnglish)
ISSN号:1433-7851
影响因子:
2013年度:11.3362012年度:13.7372011年度:13.4552010年度:12.73
分区:
文献标题:ASmall-MoleculeProtein–ProteinInteractionInhibitorofPARP1That
TargetsItsBRCTDomain
作者:NaZ;PengB;NgS;PanS;LeeJ;ShenH;YaoSQ.
日期:2015
大分子与小分子相互作用确证的主要技术:化学交联技术(chemicalcrosslinking)
第一部分:化学交联技术的简单了解
1.技术背景
蛋白质作为一种生物高分子在生命活动中起着重要的作用。尤其是在人类
组完成以后,人们认识到,对的了解并不能完全诠释全部的生命现象,
毕竟蛋白质是生命现象的直接体现,是生命活动的执行者。生命表现出多因素、
系统性、动态性的特征,蛋白质问的相互作用及功能、构象变化参与和影响着生
命的全过程,是当前生命科学研
究的一个热点。
常用的研究蛋白质相互作用的方法有:串联亲和纯化(tandemffinity
purification)、免疫共沉淀(co—immunoprecipitation)、酵母双杂交(yeasttwo
hybrid)、噬菌体展示(phagedisplay)和化学交联(chemicalcrosslinking)等
化学交联技术的应用最为久远,而随着生物质谱的出现,其应用面大为扩展,
与其他方法联合使用,结果互相验证,是研究蛋白质相互作用的有力工具。
2、技术概念
化学交联反应:指在光、热、高能辐射、机械力、超声波和交联剂等作用下,大
分子链间通过化学键联结起来,形成网状或体形结构高分子的过程。
化学交联剂:指能够和蛋白质反应的带有双功能团的化学试剂。通过功能团和
氨基酸残基反应,偶联两个蛋白质或者的蛋白质形成网状交联。功能团决定
了交联剂的反应特异性。
一种良好的化学交联剂-
作为活泼的小分子醛基试剂,常用于病理标本的保存和组织化学分析中,
它可以快速地渗透细胞膜,在细胞内产生广泛地蛋白质交联。
可能的反应机理:和精氨酸、半胱氨酸、组氨酸和赖氨酸的氨基反
应形成席夫碱的活泼,再进一步与其他氨基酸残基反应,从而形成复杂的、
网络状的交联产物
3、技术过程
基本技术过程分别为:样品的交联反应、交联产物纯化、质谱分析、数据处理
a、根据研究的目的,选择合适的化学交联剂,在生物样品中进行化学交联反应,
产生目的交联产物
b、由于蛋白质分子的复杂性、生物样品中蛋白质成分的多样性和化学交联剂特
异性的相对性,以及反应时微环境的pH、离子强度等因素的影响,反应的复杂
度大为提高,目的交联产物仅是其中非常有限的一部分。用蛋白酶目的交联
产物,使之成为质谱所能检测的多肽,此时,该多肽混合物中含有发生蛋白质相
互作用的分子间的交联产物、同一蛋白质内的交联产物及未修饰的多肽片段,使
样品的复杂度进一步提高。
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