基于WGCNA挖掘天津猴鸡裸颈性状相关基因.pdfVIP

江苏农业学报(ＪｉａｎｇｓｕＪ.ｏｆＡｇｒ.Ｓｃｉ.)ꎬ２０２４ꎬ４０(５):８８１￣８８９

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吴鹏飞ꎬ夏树立ꎬ于海涛ꎬ等.基于ＷＧＣＮＡ挖掘天津猴鸡裸颈性状相关基因[Ｊ].江苏农业学报ꎬ２０２４ꎬ４０(５):８８１￣８８９.

ｄｏｉ:１０.３９６９/ｊ.ｉｓｓｎ.１０００￣４４４０.２０２４.０５.０１３

基于ＷＧＣＮＡ挖掘天津猴鸡裸颈性状相关基因

１ꎬ２ꎬ３１ꎬ２ꎬ３１ꎬ２ꎬ３１ꎬ２ꎬ３４

吴鹏飞ꎬ夏树立ꎬ于海涛ꎬ赵向华ꎬ王康

(１.天津市农业科学院畜牧兽医研究所ꎬ天津３００３８１ꎻ２.天津市畜禽分子育种与生物技术重点实验室ꎬ天津３００３８１ꎻ３.天津

市畜禽健康养殖工程技术中心ꎬ天津３００３８１ꎻ４.扬州大学动物科学与技术学院ꎬ江苏扬州２２５００９)

摘要:天津猴鸡是中国珍贵的裸颈鸡遗传资源ꎬ为在全基因组范围内探究其裸颈发育相关基因ꎬ本研究采集

天津猴鸡杂交Ｆ代裸颈鸡和常羽鸡颈部皮肤组织用于转录组测序ꎮ加权基因共表达网络分析(ＷＧＣＮＡ)结果显

１

示ꎬ识别到的１０个基因模块中只有蓝绿色(ｔｕｒｑｕｏｉｓｅ)和蓝色(ｂｌｕｅ)基因模块与裸颈表型显著相关ꎬ共计５８３个基

因ꎻＧＯ功能富集分析富集到脂滴组织、甘油三酯储存负调控以及肌肉收缩等脂肪和肌肉相关生物学过程等条目ꎻ

ＫＥＧＧ通路分析也富集到多条脂肪代谢相关通路ꎬ包括ＰＰＡＲ信号通路和甘油酯代谢等ꎻ蛋白质互作网络分析结果

显示ＡＣＴＮ２基因编码的蛋白质的连通性最高ꎬ其次是ＭＹＬ１０基因编码的蛋白质ꎬ另外ꎬ还发现多个密切参与毛囊

发育的基因ꎬ包括ＳＯＸ９和ＰＰＡＲＧＣ等ꎮ本研究结果将为进一步揭示并完善鸡裸颈的形成和发育奠定基础ꎬ同时对

天津猴鸡的保护、开发和利用具有重要意义ꎮ

关键词:天津猴鸡ꎻ裸颈性状ꎻ加权基因共表达网络分析(ＷＧＣＮＡ)

中图分类号:Ｓ８３１.２文献标识码:Ａ文章编号:１０００￣４４４０(２０２４)０５￣０８８１￣０９

ＥｘｐｌｏｒａｔｉｏｎｏｆｇｅｎｅｓｒｅｌａｔｅｄｔｏｔｈｅｎａｋｅｄｎｅｃｋｔｒａｉｔｉｎＴｉａｎｊｉｎ￣ｍｏｎｋｅｙ

ｃｈｉｃｋｅｎｓｂａｓｅｄｏｎＷＧＣＮＡ

１ꎬ２ꎬ３１ꎬ２ꎬ３１ꎬ２ꎬ３１ꎬ２ꎬ３４

ＷＵＰｅｎｇｆｅｉꎬＸＩＡＳｈｕｌｉꎬＹＵＨａｉｔａｏꎬＺＨＡＯＸｉａｎｇｈｕａꎬＷＡＮＧＫａｎｇ

(１.ＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＡｎｉｍａｌＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＶｅｔｅｒｉｎａｒｙꎬＴｉａｎｊｉｎＡｃａｄｅｍｙｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅｓꎬＴｉａｎｊｉｎ３００３８１ꎬＣｈｉｎａꎻ２.ＴｉａｎｊｉｎＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＡｎｉｍａｌＭｏ￣

ｌｅｃｕｌａｒＢｒｅｅｄｉｎｇａｎｄＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬＴｉａｎｊｉｎ３００３８１ꎬＣｈｉｎａꎻ３.ＴｉａｎｊｉｎＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇＲｅｓｅａｒｃｈＣｅｎｔｅｒｏｆＡｎｉｍａｌＨｅａｌｔｈｙＦａｒｍｉｎｇꎬＴｉａｎｊｉｎ３００３８１ꎬＣｈｉｎａꎻ

４.ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＡｎｉｍａｌＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬＹａｎｇｚｈｏｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＹａｎｇｚｈｏｕ２２５００９ꎬＣｈｉｎａ)

Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ｔｉａｎｊｉｎ￣ｍｏｎｋｅｙｃｈｉｃｋｅｎｉｓａｐｒｅｃｉｏｕｓｇｅｎｅｔｉｃｒｅｓｏｕｒｃｅｏｆｎａｋｅｄｎｅｃｋｃｈｉｃｋｅｎｉｎＣｈｉｎａ.Ｔｏｉｄｅｎｔｉｆｙｇｅｎｅｓ

ｒｅｌａｔｅｄｔｏｔｈｅｎａｋｅｄｎｅｃｋｐｈｅｎｏｔｙｐｅａｔｔｈｅｗｈｏｌｅ￣ｇｅｎｏｍｅｌｅｖｅｌꎬｗｅｃｏｌｌｅｃｔｅｄｎｅｃｋｓｋｉｎｔｉｓｓｕｅｆｒｏ