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第４１卷第４期黑龙江大学自然科学学报Ｖｏｌ４１Ｎｏ４

２０２４年８月ＪＯＵＲＮＡＬＯＦＮＡＴＵＲＡＬＳＣＩＥＮＣＥＯＦＨＥＩＬＯＮＧＪＩＡＮＧＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹＡｕｇｕｓｔꎬ２０２４

ＤＯＩ:１０.１３４８２/ｊ.ｉｓｓｎ１００１￣７０１１.２０２４.０３.１０５投稿网址:ｈｔｔｐｓ://ｈｄｚｒｘｂ.ｃｂｐｔ.ｃｎｋｉ.ｎｅｔ

肠膜明串珠菌二鸟苷酸环化酶生物信息学分析

１１１１１ꎬ２

李腾鑫ꎬ于连升ꎬ周渤森ꎬ杨义ꎬ杜仁鹏

(１.黑龙江大学生命科学学院农业微生物技术教育部工程研究中心/黑龙江省寒区植物基因与生物发酵重点实验室/

黑龙江省普通高校微生物重点实验室ꎬ哈尔滨１５００８０ꎻ２.河北环境工程学院河北省农业生态安全重点实验室ꎬ秦皇岛０６６１０２)

摘要:环二鸟苷酸(Ｃｙｃｌｉｃｄｉｇｕａｎｏｓｉｎｅｍｏｎｏｐｈｏｓｐｈａｔｅꎬｃ￣ｄｉ￣ＧＭＰ)可以调控细菌的生存优势ꎬ从而

使细菌适应环境的改变ꎮ二鸟苷酸环化酶(ＤｉｇｕａｎｙｌａｔｅｃｙｃｌａｓｅꎬＤＧＣ)可以通过催化２个ＧＴＰ分子

合成ｃ￣ｄｉ￣ＧＭＰꎬ虽然不同来源的ＤＧＣ的催化功能类似ꎬ但是催化方式及调控通路存在较大差异ꎬ因

此表征新来源的ＤＧＣ具有重要的意义ꎮ以肠膜明串珠菌(ＬｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃｍｅｓｅｎｔｅｒｏｉｄｅｓꎬＬｎ.ｍｅｓｅｎｔｅ￣

ｒｏｉｄｅｓ)ＤＲＰ１０５中的ＤＧＣ序列为基础ꎬ进行了生物信息学分析ꎮ结果表明ꎬＤＧＣ含有５个开放阅读

框和１个保守结构域ꎬ并且与Ｌｎ.ｍｅｓｅｎｔｅｒｏｉｄｅｓＣＢＡ３６０７中含有ＧＧＤＥＦ结构域的蛋白高度相似ꎮ

理化性质分析结果表明ꎬＤＧＣ是一种定位于细胞膜上的亲水蛋白ꎬ存在６段跨膜螺旋结构ꎮ结构

预测结果显示ꎬＤＧＣ含有３段保守序列ꎬ主要由α￣螺旋和β￣折叠组成ꎬ含有ＧＧＥＥＦ结构域和Ｍｇ２＋

结合位点ꎮ分子对接结果表明ꎬ２个ＧＴＰ分子与ｃ￣ｄｉ￣ＧＭＰ的活性口袋稳定结合ꎮ本研究结果可为

后续深入探索Ｌｎ.ｍｅｓｅｎｔｅｒｏｉｄｅｓＤＧＣ的催化功能提供理论基础ꎮ

关键词:肠膜明串珠菌ꎻ二鸟苷酸环化酶ꎻ生物信息学分析ꎻ结构预测ꎻ分子对接

中图分类号:Ｑ８１９文献标志码:Ａ文章编号:１００１－７０１１(２０２４)０４－０４５３－１０

Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｏｆｔｈｅｄｉｇｕａｎｙｌａｔｅｃｙｃｌａｓｅ

ｏｆＬｅｕｃｏｎｏｓｔｏｃｍｅｓｅｎｔｅｒｏｉｄｅｓ

１１１１１ꎬ２

ＬＩＴｅｎｇｘｉｎꎬＹＵＬｉａｎｓｈｅｎｇꎬＺＨＯＵＢｏｓｅｎꎬＹＡＮＧＹｉꎬＤＵＲｅｎｐｅｎｇ

(１.ＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇＲｅｓｅａｒｃｈＣｅｎｔｅｒｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＭｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬＭｉｎｉｓｔｒｙｏｆＥｄｕｃａｔｉｏｎ/ＨｅｉｌｏｎｇｊｉａｎｇＰｒｏｖｉｎｃｉａｌＫｅｙ

ＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＰｌａｎｔＧｅｎｅｔｉｃＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇａｎｄＢｉｏｌｏｇｉｃａｌＦｅｒｍｅｎｔａｔｉｏｎＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇｆｏｒＣｏｌｄＲｅｇｉｏｎ/ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＭｉｃｒ