甜橙MYC转录因子家族鉴定与全基因组生物信息学分析.pdfVIP

２０２５年第４７卷第２期中国麻业科学ＰＬＡＮＴＦＩＢＥＲＳＣＩＥＮＣＥＳＩＮＣＨＩＮＡ６５

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文章编号:１６７１３５３２(２０２５)０２００６５１２

甜橙ＭＹＣ转录因子家族鉴定与全基因组

生物信息学分析

１２２２４４１１∗２ꎬ３∗

周家豪ꎬ张冀芳ꎬ邓勇ꎬ高泽昕ꎬ刘婕ꎬ唐瑄玥ꎬ吴卓迪ꎬ梁引库ꎬ栾明宝

(１.陕西理工大学生物科学与工程学院ꎬ陕西汉中７２３０００ꎻ

２.中国农业科学院麻类研究所ꎬ湖南长沙４１０２２１ꎻ

３.中国农业科学院三亚国家南繁研究院ꎬ海南三亚５７２０００ꎻ

４.湖南农业大学ꎬ湖南长沙４１０１２８)

摘要:为深入了解柑橘次生代谢的分子机制和通过代谢工程手段提升柑橘营养价值ꎬ试验

以甜橙为研究对象ꎬ采用生物信息学方法对ＣｓＭＹＣ转录因子进行全基因组范围内鉴定与分析ꎮ研

究共鉴定到１４个ＣｓＭＹＣ转录因子成员ꎬ分布在甜橙的４条染色体上ꎮ系统发育分析表明ꎬ甜橙中

的ＣｓＭＹＣ转录因子家族可以划分为４个亚家族ꎬ并且在同一亚家族中的大多数基因具有相似的基

－

因结构和保守基序ꎮ对奉节脐橙(ＣｉｔｒｕｓｓｉｎｅｎｓｉｓＬ.Ｏｓｂｅｃｋ“Ｆｅｎｇｊｉｅ７２１”)和埃及艳后柑橘(Ｃｉｔｒｕｓ

ｓｉｎｅｎｓｉｓＬ.ＯｓｂｅｃｋＣｌｅｏｐａｔｒａ)甜橙转录组数据进行分析ꎬ发现ＣｓＭＹＣ１在柑橘汁胞幼果中高量表达ꎬ

ＣｓＭＹＣ５在柑橘果实不同组织幼果中均高量表达ꎬＣｓＭＹＣ１１在柑橘白皮层(ＡＬ)与囊衣(ＳＭ)幼果

中均高量表达ꎮ同时ꎬＣｓＭＹＣ１、ＣｓＭＹＣ２、ＣｓＭＹＣ５和ＣｓＭＹＣ１１在热胁迫(ＨＳ)、水分胁迫和热胁迫

＋

组合(ＷＳＨＳ)下有高量表达ꎮ通过蛋白互作分析可知ꎬ与ＣｓＭＹＣ１、ＣｓＭＹＣ２、ＣｓＭＹＣ５和Ｃｓ￣

ＭＹＣ１１同源的基因ＡｔＭＹＣ１、ＡｔＢＨＬＨ１３、ＡｔＢＨＬＨ３和ＡｔＭＹＣ２直接或间接调控类黄酮合成ꎮ这４

个基因参与植物防御且均可能参与了柑橘果实类黄酮的生物合成ꎮ研究结果为ＣｓＭＹＣ基因的功

能研究奠定了基础ꎮ

关键词:ＭＹＣ基因家族ꎻ系统发育ꎻ类黄酮

中图分类号:Ｓ６６６.４文献标识码:Ａ开放科学(资源服务)标识码(ＯＳＩＤ):

ＩｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓＡｎａｌｙｓｉｓｏｆ

ＳｗｅｅｔＯｒａｎｇｅＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎＦａｃｔｏｒＭＹＣＦａｍｉｌｙ

１２２２４４

ＺＨＯＵＪｉａｈａｏꎬＺＨＡＮＧＪｉｆａｎｇꎬＤＥＮＧＹｏｎｇꎬＧＡＯＺｅｘｉｎꎬＬＩＵＪｉｅꎬＴＡＮＧＸｕａｎｙｕｅꎬ

１１∗２ꎬ３∗

ＷＵＺｈｕｏｄｉꎬＬＩＡＮＧＹｉｎｋｕꎬＬＵＡＮＭｉｎｇｂａｏ

(１.ＳｃｈｏｏｌｏｆＢｉｏｌｏｇｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇꎬＳｈａａｎｘｉＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬ

Ｈａｎｚｈｏｎｇ７２３０００ꎬＳｈａａｎｘｉꎬＣｈｉｎａꎻ

２.ＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＢａｓｔＦｉｂｅｒＣｒｏｐｓꎬＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅｓꎬ

Ｃｈａｎｇｓｈａ４１０２２１ꎬＨｕ