基于前列腺癌肿瘤相关成纤维细胞的单细胞转录组的生物信息学分析.pdfVIP

HansJournalofBiomedicine生物医学,2024,14(3),359-368

PublishedOnlineJuly2024inHans./journal/hjbm

/10.12677/hjbm.2024.143040

基于前列腺癌肿瘤相关成纤维细胞的单细胞

转录组的生物信息学分析

1*2

李洋，李延春

1吉林工商学院工学院，吉林长春

2吉林大学化学学院理论化学研究所，吉林长春

收稿日期：2024年4月12日；录用日期：2024年5月31日；发布日期：2024年6月12日

摘要

本研究运用生物信息学分析方法对前列腺癌(PCa)相关的单细胞数据进行了深入研究。首先，我们从GEO

数据库中筛选出了1035个与肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)相关的差异表达基因。然后，我们选取了其中最

显著的Top100个基因，通过蛋白质相互作用网络分析得到了10个核心差异表达基因。进一步利用

GEPIA2工具进行生存预后分析，发现MYLK、MYH11、COL18A1和CALD1可能与前列腺癌的预后显著

相关。这些结果为我们深入探究前列腺癌的发病机制提供了重要的信息，有助于制定个体化的治疗策略。

关键词

前列腺癌，单细胞，差异基因分析，生物信息学分析

BioinformaticsAnalysisofSingle-Cell

TranscriptomeBasedonProstate

CancerCancer-Associated

Fibroblasts

YangLi1*,YanchunLi2

1

SchoolofTechnology,JilinBusinessandTechnologyCollege,ChangchunJilin

2

InstituteofTheoreticalChemistry,CollegeofChemistry,JilinUniversity,ChangchunJilin

thstth

Received:Apr.12,2024;accepted:May31,2024;published:Jun.12,2024

*通讯作者。

文章引用:李洋,李延春.基于前列腺癌肿瘤相关成纤维细胞的单细胞转录组的生物信息学分析[J].生物医学,2024,

14(3):359-368.DOI:10.12677/hjbm.2024.143040

李洋，李延春

Abstract

Thisstudyutilizedbioinformaticsanalysismethodstoconductin-depthresearchonsingle-cell

datarelatedtoprostatecancer(PCa).Initially,wescreened1035differentiallyexpressedgenes

relatedtocancer-associatedfibroblasts(CAFs)fromtheGEOdatabase.Subsequently,weselected

themostsignificantTop100genesandidentified10coredifferentiallyexpressedgenesthrough

protein-proteininteractionnetworkanalysis.Further,usingGEPIA2tool,weperformedsurvival

prognosisanalysisandfoundthatMYLK,MYH11,COL