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现代农业科技2025年第2期动物科学·生物技术
白桦BpHsfA4a基因克隆及生物信息学分析
宋雨瞧
(东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室,黑龙江哈尔滨150040)
摘要白桦(BetulaplatyphyllaSuk.)是生长速度较快的落叶乔木树种,具有较强的耐寒性和环境适应性,通
过发掘白桦抗逆基因来揭示其抗逆机制,有助于改良白桦的抗逆性。热应激转录因子(heatstresstranscription
factors,HSFs)是广泛存在于植物细胞内的一类转录因子,用以响应植物应对逆境胁迫的机制。在对白桦进行盆
栽控盐的基础上,提取白桦总RNA制备转录组文库,构建级联调控网络,其中BpHsfA4a基因调控植物耐盐的效
果明显。基于这一表现,利用生物信息学分析软件对BpHsfA4a基因的基本理化性质进行分析,对BpHsfA4a基因
编码蛋白的保守结构域、亲水性/疏水性、跨膜结构、亚细胞定位和多重序列比对情况等进行推断。结果表明,
BpHsfA4a蛋白分子质量为44.14kD,编码序列长度为1170bp,等电点为5.14,编码氨基酸389个,亚细胞定位
显示位于细胞核。多重序列比对及系统进化分析表明,BpHsfA4a与其他植物的HsfA4a有较高的一致性,与大叶
栎的一致性最高。这为进一步揭示BpHsfA4a的功能提供了初步的分子基础。
关键词白桦;BpHsfA4a;基因克隆;生物信息学分析;逆境胁迫
DOI:10.3969/j.issn.1007-5739.2025.02.045开放科学(资源服务)标识码(OSID):
白桦(BetulaplatyphyllaSuk.)分布于中国东北、西在植物对非生物胁迫的防御应答中,HSFs扮演
北和华北地区,生长速度快,具有重要的森林涵养价着重要的调节角色,包括参与生物和非生物胁迫的应
[1][7]
值。白桦不仅可以提供生产材料和能源,还在生态系答。植物中的HSF家族可以分为A、B、C共3个亚
统中起着维持平衡的重要作用,包括防风固沙、水土族,其中A类HSFs是热胁迫中的主要调节因子,可
[8]
保持、调节气候等。作为重要的落叶乔木树种之一,诱导抗逆基因表达。随着全基因组的测序和研究的
[2]逐步完善,目前在全基因组范围内已经发现了超过
白桦表现出了很强的耐寒性和环境适应性,是国家
科技攻关研究的重点树种。我国近年对白桦的育种20种植物HSF基因家族。其中,在拟南芥、番茄、水
也开展了大量研究工作,其中不乏基因工程技术的应稻、烟草、胡萝卜、大豆和小麦中分别鉴定出21、24、
[9]
用,旨在克服传统育种的弊端,缩短育种周期。25、24、35、52、56个HSF家族成员。
20世纪80年代中期,科研人员首次在DNA序列作为重要的转录因子之一,HSFs通过磷酸化、寡
中确定了特定转录因子的结合位点。随后,通过足迹聚化、核转位等过程形成转录复合体,启动和调控多
法(footprintingassay)和亲和层析法(affinitychroma-种逆境胁迫相关基因和热应激蛋白的转录与表达,从
[10]
tography)对热应激转录因子(heatstresstran
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