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—２２—江苏农业科学２０２５年第５３卷第７期

宗琳皓，吴彤，徐，等．水稻ＰＥＰＣＫ基因家族的生物信息学和表达分析［Ｊ］．江苏农业科学，２０２５，５３（７）：２２－２８．

ｄｏｉ：１０．１５８８９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００２－１３０２．２０２５．０７．００３

水稻ＰＥＰＣＫ基因家族的生物信息学和表达分析

宗琳皓，吴彤，徐，高志萍

（南京师范大学生命科学学院，江苏南京２１００２３）

摘要：磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶（ＰＥＰＣＫ）普遍存在于开花植物中，是将草酰乙酸（ＯＡＡ）转变为磷酸烯醇式丙酮

酸（ＰＥＰ）的关键酶，参与植物体多条代谢途径。ＰＥＰＣＫ由ＰＥＰＣＫ基因编码，本研究通过全基因组数据，鉴定编码水稻

ＰＥＰＣＫ蛋白的基因家族成员，并围绕水稻ＰＥＰＣＫ基因家族的理化性质、亚细胞定位、保守基序、顺式作用元件、组织

特异性表达、胁迫下表达以及进化关系等方面进行生物信息学分析。结果显示，水稻全基因组共有４个ＰＥＰＣＫ基因，

其中一个成员（Ｏｓ０３ｇ０２５５５００）含有２条转录本，并且家族成员分布在水稻３号、４号以及１０号染色体上，具有相似的

保守基序；顺势作用元件分析以及基因表达分析显示，该基因家族在水稻光合作用碳反应、种子萌发、防御与应激、抵

御干旱胁迫等生理功能方面具有重要作用；利用不同碳代谢类型植物的ＰＥＰＣＫ基因家族蛋白进行系统发育树构建，

并对禾本科植物ＰＥＰＣＫ基因家族进行共线性分析，结果显示，植物ＰＥＰＣＫ基因在不同碳代谢类型植物中较为保守，

且其进化在禾本科不同物种间经历相似途径。本研究为明确水稻ＰＥＰＣＫ基因家族各成员的功能提供了参考依据。

关键词：水稻；磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶；生物信息学；表达特征；共线性分析

中图分类号：Ｓ１８８；Ｓ５１１．０１文献标志码：Ａ文章编号：１００２－１３０２（２０２５）０７－００２２－０７

植物磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶（ＰＥＰＣＫ）可逆生产体系中占据着举足轻重的地位。近年来，在水

催化草酰乙酸（ＯＡＡ）脱羧，且该酶是催化糖异生途稻中与生长发育、逆境胁迫相关的基因被相继研

径的关键限速酶之一，同时也是连接糖异生、糖酵究，ＰＥＰＣＫ早期被认为参与Ｃ植物光合作用而只

４

解及有机酸代谢等多种代谢途径的重要桥梁。前存在于Ｃ植物中，近年来发现水稻中也存在

４

［７］

期研究表明，在贮油植物的种子萌发子叶还未具备ＰＥＰＣＫ，但目前关于水稻ＰＥＰＣＫ基因家族的研究

光合作用能力前，还不够全面。本研究通过生物信息学方法，从水稻

ＰＥＰＣＫ可催化脂肪氧化产物ＯＡＡ

脱羧形成磷酸烯醇式丙酮酸（ＰＥＰ），进而为植物生全基因组中鉴定出ＰＥＰＣＫ基因家族成员，对其理化

［１］性质进行分析并进行亚细胞定位预测，通过注释文

长提供有机碳源。在Ｃ和景天酸代谢途径

４

（ＣＡＭ）植物中，ＰＥＰＣＫ还可以催化由苹果酸或天冬件得到ＰＥＰＣＫ基因家族的染色体位置、基因结构、

氨酸衍生的ＯＡＡ脱羧，为卡尔文循环提供二氧化保守基序等信息，并进行启动子顺式作用元件的预

碳［２－３］。在水稻中转入玉米ＰＥＰＣＫ基因后，水稻脱测，同时针对水稻ＰＥＰＣＫ基因家族的表达模式和对

落酸（ＡＢＡ）信号通路增强、苹果酸代谢受到调节、非生物胁迫的响应进行分析，期望揭示水稻ＰＥＰＣＫ

气孔关闭得到促进，表明ＰＥＰＣＫ在响