第二章蛋白质的基础知识.pptVIP

蛋白质按不同的结构水平分蛋白质分子中的共价键有肽键和二硫键。是生物大分子分子之间最强的作用力，化学物质（药物、毒物等）可以与生物大分子（受体蛋白或核酸）构成共价键，共价键除非被体内的特异性酶催化断裂以外，很难恢复原形，是不可逆过程，对酶来讲就是不可逆抑制作用。生物体系中分子识别的过程不仅涉及到化学键的形成，而且具有选择性的识别。共价键存在于一个分子或多个分子的原子之间，决定分子的基本结构，是分子识别的一种方式。而非共价键（又称为次级键或分子间力）决定生物大分子和分子复合物的高级结构，在分子识别中起着关键的作用。但是这些键的键能小，所以不稳定，易受各种理化因素影响被破坏。1、氢键：由连接在一个电负性大的原子上的H与另一个负电性原子之间相互吸引而形成的化学键。在次级键中，氢键的数量最多，键能最小，普遍存在于蛋白质分子中，是形成α-螺旋和?-折叠的基础。2、配位键：一种共价键。成键的两个原子间共享的两个电子不是由两原子各提供一个，而是来自一个原子。（两个原子间由单方面提供共用电子对而形成的化学键）3、疏水键：蛋白质分子中两个疏水性较强的侧链基团为避开水而相互黏附在一起的作用力。蛋白质分子中疏水性较强的基团大部分集中在分子内部，它是维持蛋白质三四级结构的主要次级键。4、盐键：存在于两个相反电荷的基团之间的静电吸引力。5、范德华力：存在于分子间的一种吸引力，比化学键弱得多。一级结构是蛋白质最基本的结构，它的内容决定着蛋白质的高级结构和生物学功能一级结构是高级结构的化学基础，它包含了决定蛋白质分子所有结构层次构象的全部信息。也是认识蛋白质分子生物功能、结构与生物进化的关系、结构变异与分子病的关系等许多复杂问题的重要基础。四十年代起，许多人不遗余力从事蛋白质的一级结构研究。1954年英国生化学家Sanger报道了胰岛素的一级结构，是世界上第一例确定一级结构的蛋白质。Sanger由此1958年获Nobel化学奖。1965年我国科学家完成了结晶牛胰岛素的合成，是世界上第一例人工合成蛋白质。研究蛋白质的一级结构，就是要将氨基酸的排列顺序搞清楚。意义：为人工合成蛋白质及基因提供蓝图蛋白质的二级结构：通过肽链上的羰基O和亚氨基H之间形成的氢键，使肽链主链骨架上的局部区域形成有规则的空间排布。这种主链上的有规则的空间排布称为蛋白质的二级结构。α-螺旋：蛋白质中最常见最典型的二级结构——刚性①二面角：Φ=-57°,Ψ=-47°，是一种右手螺旋右手螺旋空间位阻较小，比较符合立体化学的要求，易于形成，构象稳定。而左手α-螺旋虽然很少，但也偶尔会出现，如：嗜热菌蛋白酶中就有很短一段左手α-螺旋⑥影响形成和稳定的因素：氨基酸组成和排列顺序酸性或碱性氨基酸集中的区域，由于同电荷相斥，不利于α-螺旋形成较大的R基集中的区域，也会妨碍α-螺旋的形成甘氨酸的R基为H，空间占位很小，会影响该处螺旋的稳定脯氨酸因其Cα位于五元环上，不易扭转，加之他是亚氨基酸，不易形成氢键。所以多肽链中只要存在脯氨酸，α-螺旋即被中断类似棒状的结构紧密卷曲的多肽链构成棒的中心部分侧链R基伸出到螺旋排布的外面2、β-折叠结构：β-片层——柔性两条或多条几乎完全伸展的多肽链（或同一肽链的不同肽段）侧向聚集在一起，相邻肽链主链上的NH和C=0之间形成氢链，这样的多肽构象就是β-折叠。结构特征：①所有的肽键都参与了氢键的形成，氢键与肽链的长轴接近垂直。②多肽主链是比较伸展的，呈锯齿状折叠构象。③侧链R基交替地分布在片层平面的上下，以避免相邻R基的空间障碍3、?-转角：?-弯曲、?-回折、发夹结构——刚柔并重蛋白质分子的多肽链在形成空间构象时出现的180°回折，回折处的结构就称为?-转角。主要存在于球状蛋白分子表面。主要特征：①由多肽链上4个连续的氨基酸残基组成。②主链骨架以180°返回折叠。③第一个a.a残基的C=O与第四个a.a残基的N-H生成氢键④C1α与C4α之间距离小于0.7nm甘氨酸和脯氨酸容易出现在这种结构中。以上维持二级结构的作用力——氢键?某些肽链中存在的规则性不强的构象（没有规律的多肽链主链骨架构象），往往与生物活性有关结构特征：①肽段有更大的任意性。所以不能归入明确的二级结构的多肽区段②稳定、非重复性结构。③受R基的影响较大，经常是构成酶活性部位和其他蛋白质特异的功能部位。指多肽链在二级结构、超二级结构乃至结构域的基础上，沿多个方向进一步折叠、卷曲形成的一个紧密的近似球形的结构。包括多肽链中一切原子的空间排列方式。简单来说：一条多肽链中所有原子在三维空间的整体排布。维系这种特定结构的力主要有氢键、疏水键、离子键和范德华力等。尤其