马氏珠母贝CD-MPR基因序列特征及其在耐低温品系的选择分析.pdfVIP

南方农业学报JournalofSouthernAgriculture2023，54（4）：1224-1234

·1224·南方农业学报54卷

ISSN2095-1191；CODENNNXAAB

DOI：10.3969/j.issn.2095-1191.2023.04.027

马氏珠母贝CD-MPR基因序列特征及其

在耐低温品系的选择分析

11111，21，21，2*

韩书雅，钟如卓，伍灵君，宋欣霖，赖卓欣，郑哲，王庆恒

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（广东海洋大学水产学院，广东湛江524088；广东省珍珠科技创新中心/广东省海水养殖生物育种工程实验室/

广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室，广东湛江524088）

摘要：【目的】明确马氏珠母贝（Pinctadafucatamartensii）阳离子依赖性甘露糖-6-磷酸受体（CD-MPR）基因

（PmCD-MPR）多态性与其低温耐受能力的相关性，为马氏珠母贝耐低温品系的选育提供理论依据。【方法】采用

RACE克隆PmCD-MPR基因序列全长，并运用实时荧光定量PCR检测PmCD-MPR基因在马氏珠母贝各组织及低温胁

迫下的表达模式；基于马氏珠母贝耐低温选育系（R群体）和北部湾野生群体（W群体）的全基因组重测序数据筛选出

PmCD-MPR基因外显子区的SNP位点，并通过遗传多态性分析、单倍型分析及频率计算获取与马氏珠母贝低温胁迫

过程相关的SNP位点。【结果】PmCD-MPR基因序列全长902bp，其开放阅读框（ORF）为792bp，共编码263个氨基酸

残基；PmCD-MPR基因编码蛋白分子量为30.22kD，理论等电点（pI）为5.79，属于亲水性蛋白，在第18~263位氨基酸

处含有1个典型的甘露糖-6-磷酸受体（Man-6-P_recep）结构域。CD-MPR氨基酸序列在N端的相似性较低，在C端的

相似性较高；基于CD-MPR氨基酸相似性构建的系统发育进化树显示，马氏珠母贝与长牡蛎、加利福尼亚海兔等软体

动物聚为一支，与经典的动物学分类相吻合。PmCD-MPR基因在马氏珠母贝肝胰腺的相对表达量最高，显著高于在

性腺、闭壳肌和外套膜中的相对表达量（P0.05，下同）；低温胁迫组马氏珠母贝鳃组织中的PmCD-MPR基因相对表

达量随着胁迫时间的延长整体上呈先上升后下降的变化趋势。从PmCD-MPR基因外显子区筛选获得34个SNPs位

点，且这34个SNPs位点构成5个单倍块和15种单倍型，其中GCC、TG、CCCTCT等3种单倍型在R群体中的分布频率显

著高于W群体，即与马氏珠母贝耐低温性状显著相关。【结论】PmCD-MPR基因参与马氏珠母贝的低温响应过程，与

耐低温性状显著相关的基因型及单倍型可作为马氏珠母贝耐低温品系辅助育种的候选分子标记。

关键词：马氏珠母贝；PmCD-MPR基因；低温耐受；SNP位点；选择分析

中图分类号：S968.316.1文献标志码：A文章编号：2095-1191（2023）04-1224-11

SequencecharacteristicsofCD-MPRgeneinPinctadafucata

martensiianditsselectionanalysisinlow-temperature

resistantstrains

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