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«淮海医药»2025年5月第43卷第3期JHuaihaiMedꎬMay2025ꎬVol43ꎬNo3259
DOI:10.14126/j.cnki.1008-7044.2025.03.009临床经验
基于生物信息学分析MXD1基因在食管癌中的表达及对患者预后的影响
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张心慈ꎬ孙宇晴ꎬ任依涵ꎬ夏欣怡ꎬ周涛ꎬ罗杭ꎬ吴华彰
[摘要]目的:探讨MAX二聚化蛋白1(MXD1)基因在食管癌细胞和癌旁组织中的表达情况ꎬ及其对食管癌患者预后的影响ꎮ
方法:利用GEO表达谱数据库下载基因芯片GSE20347数据ꎬ利用R语言分析食管癌与配对癌旁组织中差异表达的基因ꎬ并
绘制火山图ꎻ利用GO功能富集分析筛选出差异基因显著富集的分子功能ꎻ利用Kaplan ̄MeierPlotter在线网站对食管癌患者中
的差异表达基因进行生存分析ꎻ采用GSEA软件ꎬ将从TCGA数据库下载得到的食管癌相关基因进行KEGG信号通路富集分
析ꎻ最后通过在线网站STRING构建差异表达基因蛋白互作(PPI)网络ꎮ结果:通过分析基因芯片(GSE20347)获得371个差
异表达的基因ꎻGO功能富集分析发现差异表达基因主要富集于酶抑制活性方面ꎻ生存分析显示当差异基因MXD1、SERPINB4
高表达时ꎬ食管癌患者的预后相对较差ꎬ且MXD1在癌症细胞与癌旁组织中的表达差异高于SERPINB4ꎻGSEA富集分析和PPI
网络显示MXD1可能通过调控PI3K/Akt信号通路参与食管癌的恶性进展ꎮ结论:MXD1在食管癌组织中高表达ꎬ其高表达与
患者不良预后相关ꎮ
[关键词]食管肿瘤ꎻMXD1基因ꎻ生物信息学ꎻ预后
[中图分类号]R7351[文献标识码]A[文章编号]1008 ̄7044(2025)03 ̄0259 ̄04
食管癌是全球高发恶性肿瘤之一ꎬ长期吸烟、饮GEO(GeneExpressionOmnibus)数据库下载食管癌
酒、不良饮食习惯、胃食管反流等是食管癌形成的因基因表达谱芯片数据(GSE20347)ꎬ对癌组织与正常
[1 ̄2]
素ꎮ食管癌有2种亚型ꎬ分别为食管腺癌和食管组织的基因表达进行差异分析ꎬ并进一步进行富集
[3]
鳞状细胞癌ꎮ食管鳞癌最常见的发病部位为食分析和生存分析ꎬ旨在为食管癌的诊断和治疗提供
管上、中三分之一ꎬ而食管腺癌则好发于食管下端近新的选择ꎮ
[4]
贲门部或食管胃交界处ꎮ早期食管癌患者无明
1材料与方法
显症状ꎬ多数在确诊时已处于晚期ꎬ错过了最佳治疗
时机ꎮ手术切除是食管癌的首选治疗方法ꎬ目前以1.1数据收集及处理从GEO数据库中下载
胸(腹)腔镜为代表的微创技术广泛应用于食管癌GSE20347的数据集ꎮGSE20347数据集包含了17
外科治疗ꎬ但其会使患者出现较为严重的应激反应对食管鳞状细胞癌组织样本及其配对的癌旁组织样
[5]
和术后疼痛ꎮ另外ꎬ腹部手术史、外周血管疾病本的基因芯片ꎬ样本来源与研究目标具有高度适配
史、术后应用呼吸机、胃供血动脉钙化等是术后发生性且配对设计减少了患者个体差异对基因表达的影
[6]
吻合口瘘的独立危险因素ꎮ晚期食管癌患者常响ꎮ随后利用RStudio软件ꎬ对GSE20347基因芯
伴有高度淋巴结转移风险ꎬ即使接受手术切除ꎬ由于片数据进行合并和批次矫正ꎬ从而得到相应的矩阵
食管癌的特殊解剖位置ꎬ彻底清除已转移的淋巴
人力资源管理师持证人
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