同源建模详细讲解整理版.pptVIP

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报告内容;、结构生物学;三维结构;总结来说;射线晶体衍射();;数据库;蛋白质结构预测之同源建模;同源建模的基本步骤;同源建模在线服务器;同源建模软件;图形化软件;;;;;;;;;;;;;;;;;、指定工作目录;;同源模建结果评价与改进策略;:以中高分辨的晶体结构参数为参考,给出提交模型的一系列立体化学参数(主链)。其输出的结果包括:拉氏图,主链的键长与键角,二级结构图,平面侧链与水平面之间的背离程度等。

:包含大量的检测项,可以针对提交的蛋白结构与正常结构之间的差异,产生一个非常长而且详细的报告。

:计算范围之内,不同原子类型对之间形成的非键相互作用的数目(侧链)。原子按照、、进行分类,所以有六种不同的相互作用类型:、、、、、。得分>比较好。;:比较模型和氨基酸一级结构的关系,获得评价即可。

:与预先计算好的一系列标准体积之间的差别。用来表示。作为一个统计学值,可以显示模板蛋白质和待测蛋白之间的匹配程度,当较低时,就意味着没有匹配搜索的结构;实例;;;;;;();模型质量检验;;;;;;进行优化;修正前;模型质量再检测;优化前;;后续优化;;;谢谢!

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