基于无监督学习方法的细胞膜内单分子扩散运动分析：胆固醇对模型膜和活细胞膜流动性的不同影响.pdfVIP

物理学报

Acta

Phys.

Sin.Vol.73,No.18(2024)188702

封面文章

基于无监督学习方法的细胞膜内单分子扩散运动分析:

胆固醇对模型膜和活细胞膜流动性的不同影响*

1)2)#2)3)#2)#4)5)

谭金鹏

张婉婷

徐成

卢雪梅

1)3)5)†2)‡

朱文圣

杨恺

元冰

1)

(东北师范大学数学与统计学院,

长春130024)

2)

(松山湖材料实验室,

东莞523808)

3)

(苏州大学物理科学与技术学院,

软凝聚态物理及交叉研究中心,

苏州215006)

4)

(苏州城市学院光学与电子信息学院,

苏州215104)

5)

(苏州大学,

前沿材料物理与器件省高校重点实验室,

苏州215006)

(2024

年7

月2日收到;

2024

年7

月31日收到修改稿)

单分子运动追踪是研究软物质体系尤其是生命体系动力学过程和分子相互作用的重要方法,

但如何理

解生命体系中单分子运动行为的复杂性仍是一个巨大的挑战.

针对这一问题,

本工作提出了一种可对单分子

轨迹进行高效识别和分类的、基于无监督学习的“两步归类法”:

首先利用熵约束最小二乘法对扩散轨迹的受

限程度进行区分,

继而通过统计检验将非受限轨迹划分为亚扩散、正常扩散和超扩散等不同运动模式类型.

利用该方法,

本工作解析了DOPC模型细胞膜和活细胞膜内的单分子扩散运动特征,

揭示了胆固醇成分对二

者的差异影响.

结果显示:

模型膜和活细胞膜均包含多种不同的扩散模式;

在DOPC模型膜体系中,

胆固醇

成分会阻碍膜内的分子扩散运动,

且阻碍程度与胆固醇含量正相关;

在活细胞体系中,

分子运动速率显著低

于模型膜体系,

并且,

胆固醇的去除会进一步减慢分子扩散速率.

本研究有助于从单分子运动角度深入理解

生物分子运动行为的复杂性及其对体系环境的依赖性.

关键词：单分子运动,

无监督学习,

模型细胞膜,

胆固醇

PACS：87.16.D–,

87.15.K–,

87.15.H–,

87.15.VvDOI:10.7498/aps.73

膜的流动性受到细胞膜组分多样性和膜内环境拥

1

引言挤性等因素的强烈影响,

并呈现出与功能相关的空

间异质性(从分子水平上形成的脂筏到中尺度水平

细胞膜的流动性是其重要特征之一,

与许多基