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病毒性腹泻标本的处理和病原检测方法
一、标本的处理
制备10%的便悬液:将粪便标本加到1.5mlEP管中,加入标本处理液,震荡3次,
每次10秒。然后静置10分钟,再以8千转/分钟离心5分钟,吸取上清进行下一步试
验或-20℃短期保存。
二、轮状病毒ELISA检测(采用DAKO轮状病毒ELISA检测试剂盒)
1、在试剂盒96孔板中每孔加入100μl便悬液离心后的上清,然后与100μl酶结
合物混合,作用1小时,将液体倒掉,并用洗液冲洗4遍,再用卫生纸拍打试剂盒板,
甩干液体。然后加100μl显色液,作用10分钟,最后加终止液。
2、结果判断:如果标本孔中为黄色,则轮状病毒检测阳性,如果是无色,则轮状
病毒阴性。
3、每次检测样本时分别设置阳性对照和阴性对照。
具体事宜请参考试剂盒说明书。
三、核酸提取(采用Geneaid病毒核酸提取试剂盒)
可用于同时提取病毒DNA和RNA。
1、在实验开始前,在ADBuffer和WashBuffer中分别加入30ml和50ml
96-100%的乙醇。
2、将200µl10%便悬液加入EP管中。
3、加400µlVBLysisBuffer至已加入便悬液的EP管中,vortex混匀。
4、室温(15~25℃)孵育10min。
5、将VB柱子放入2ml收集管中。
6、加450µl已加乙醇的ADBuffer至上述样本溶解产物中,vortex混匀。
7、小心地打开VB柱盖子,将600µl溶解混合物移至VB柱子中,注意不要弄湿柱
子边缘,盖上盖子,13000rpm离心1min。弃去滤过液,仍将柱子放入原收集管中。
8、小心地打开VB柱盖子,将剩余的样本溶解混合物移至VB柱子中,盖上盖子,
离心13000rpm1min。弃去包含有滤过液的收集管,将VB柱子放入另一新的收集管中。
9、小心地打开VB柱盖子,加400µlW1Buffer至VB柱子中,盖上盖子,离心
13000rpm30Secs。弃去滤过液,仍将柱子放入原收集管中。
10、小心地打开VB柱盖子,加600µl已加过乙醇的WashBuffer至VB柱子中,
盖上盖子,13000rpm离心30Secs。弃去收集管中滤过液。13000rpm,离心空柱子3min。
11、将干燥的VB柱放入干净的1.5mlEP管中。弃去包含有滤过液的收集管。
12、小心地打开VB柱盖子,加50µlRNase-free水至VB柱中进行洗脱,盖上盖
子,室温孵育3min,13000rpm离心1min。病毒DNA进行PCR,或贮存于-20℃或-
70℃备用。
具体事宜请参考试剂盒说明书。
四、轮状病毒分型
轮状病毒阳性的标本进一步进行基因分型,毒株分型采用逆转录-聚合酶链反应
(RT-PCR)进行。
G血清型分型,一次扩增采用编码VP7基因的保守序列设计引物(正链引物9Con1,
负链引物9Con2),扩增基因的片断,二次扩增正链引物为基因保守序列的公用引物
(9Con1),负链引物根据基因内不同血清型的特征序列设计一组分型引物(9T1、9T2、
9T3、9T4、9T9B),这样从扩增产物的特征分子量大小即可区别轮状病毒的不同血清型。
P基因型分型,其引物设计原理类似,一次扩增引物(4Con3、4Con4)选择VP4基
因内的保守序列,二次扩增负链引物选择不同基因型的特征序列,设计一组分型引物
(1T1、2T1、3T1、4T1、5T1),正链引物仍采用公用引物(4Con3)。试验所需引物序
列和设计扩增产物大小请见表1。G、P分型的具体实验操作步骤如下:
1.核酸变性
G分型时,在0.2ml的EP管中加入正链引物20μM9Con1和负链引物20μM9Con2
各1μl、RNA模板5μl、DEPC处理过的水3μl混合后放在98℃超级微量恒温器中变
性5分钟后,立即放入冰中。P分型时
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