甘蓝BoNHX基因家族生物信息学分析与鉴定.pdfVIP

年第期

20253

甘蓝BoNHX基因家族生物信息学分析与鉴定

123

,,

吴沁安张萌丁一娟

(,;,;

西藏自治区农牧科学院西藏拉萨西藏自治区农牧科学院蔬菜研究所西藏拉萨西南大学农学与

1.8500322.8500303.

,)

生物科技学院重庆400715

:,,

摘要为鉴定并分析甘蓝基因家族成员的生物信息利用氨基酸特定序列比对和隐马尔可夫模型的蛋白结构域在

NHX

,;、、

甘蓝全基因组中筛选并鉴定出基因家族成员个命名为利用

NHX11BoNHX1~BoNHX11TBtoolsMEGA11Plant-

、。:

等软件和网站进一步分析个甘蓝基因家族成员的理化性质结果表明个家族成员编码氨基酸

CAREMEME11NHX11

,,。

127~1166个分子量为14174.59~128874.77Da等电点在5.16~9.33在拟南芥与甘蓝NHX家族成员构建的系统进

,//,。

化树中所有基因家族成员被分为ABC3个亚家族每个亚家族成员在3~12个不等对家族成员进行顺式作用元件预

,、、。,

测主要集中在光反应激素响应低温应答等过程在拟南芥与甘蓝物种间共线性分析中两者之间存在对共线性关

12

;,。,

系在甘蓝物种内共线性分析中有对共线性关系在甘蓝基因组中共鉴定出基因家族成员个进一步分析表

6NHX11

,、。