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塔里木盆地叶城沙蜥：微卫星位点筛选及种群遗传结构解析

一、引言

1.1研究背景与意义

叶城沙蜥（Phrynocephalusaxillaris）作为中国特有的沙蜥属物种，在生物多样性研究中占据着独特的地位。它仅分布于天山山脉以南的干旱荒漠区，尤其是塔里木盆地，成为了研究干旱生态系统的关键指示物种。其对极端干旱环境的独特适应性，为揭示生物与环境的相互作用机制提供了宝贵的研究素材，在进化生物学和生态学领域具有极高的研究价值。

塔里木盆地作为世界上最大的内陆盆地之一，拥有独特而脆弱的生态系统。叶城沙蜥在该区域的生态系统中扮演着重要角色，其种群动态和遗传结构的变化，不仅反映了自身物种的生存状况，也能折射出整个生态系统的健康程度和稳定性。深入研究叶城沙蜥，对于理解塔里木盆地生态系统的结构和功能，以及预测其对环境变化的响应，具有不可替代的重要意义。

从物种保护角度来看，随着全球气候变化和人类活动的加剧，叶城沙蜥的生存面临着诸多威胁，如栖息地丧失、破碎化以及气候变化导致的干旱加剧等。了解其微卫星位点和种群遗传结构，能够为制定科学有效的保护策略提供关键的遗传学依据，有助于保护这一珍稀物种的遗传多样性，维护生态平衡。

1.2叶城沙蜥概述

叶城沙蜥是鬣蜥科沙蜥属的爬行动物，体形较大，头体长一般在43-56毫米，尾长61-75毫米。其头大，长宽略相等，吻端尖，鼻孔间距小，有独特的腋斑，尾的腹面有黑环，尾尖白色，这些特征使其在沙蜥属中易于辨认。其背面沙黄色，但色纹变异极大，在不同地区采集的标本呈现出不同的斑纹形态，如在叶城采得的有全为细纹而无斑块的标本，吐鲁番的蜥体上则在眼间有深色长三角形斑或横纹。

叶城沙蜥主要分布于中国新疆、甘肃、西藏等地的戈壁荒漠或沙漠边缘地带，垂直分布的海拔高度为65-3000米，在阿尔金山南麓甚至可达3000米左右。在塔里木盆地，它广泛分布于哈密、疏勒、吐鲁番、罗布泊等众多地区，是当地生态系统中的常见物种。

在塔里木盆地的生态系统中，叶城沙蜥主要栖息在生长着骆驼刺和白刺等少数植物的戈壁荒漠或沙漠边缘地带。其生活力极强，能深入几乎寸草不生和昆虫罕见的浩瀚戈壁内。夏季午前活动极为频繁，主要以蚂蚁为食，食物中蚂蚁占比达90%，其余为昆虫，尤多鞘翅目、同翅目种类及其幼虫，也会食用少量小蝗虫和植物种子。它是卵生动物，六七月份产卵，卵产在沙土之中，靠沙土温度自然孵化，孵化期40-50天。

1.3微卫星标记技术及其应用

微卫星标记技术，也称为简单序列重复（SSR）标记技术，是一种基于DNA序列多态性的分子标记技术。微卫星是由1-6个碱基组成的短序列重复，这些重复单元以高度可变的方式分布在基因组中。其两端序列多是保守的单拷贝序列，利用这一特性，可以根据微卫星区域特定顺序设计成对引物，通过聚合酶链式反应（PCR）扩增微卫星序列。由于不同个体的微卫星重复单位的次数不同或重复程度不完全相同，扩增产物的长度会呈现差异，通过聚丙烯酰胺凝胶电泳或琼脂糖凝胶电泳分离扩增产物，就能显示出SSR位点在不同个体间的多态性，从而对不同个体之间的遗传差异进行分析。

微卫星标记技术具有高度多态性，能够提供丰富的遗传信息，可用于检测种群内和种群间的遗传变异；高度可重复性，实验结果稳定可靠，不同实验室之间的结果具有可比性；高度稳定性，在不同的实验条件下，微卫星标记的扩增结果相对稳定；高度灵敏性，能够检测到基因组中微小的遗传变化。

在叶城沙蜥的遗传研究中，微卫星标记技术可用于遗传多样性分析，评估不同种群的遗传丰富度和遗传结构，了解种群的进化历史和遗传关系；亲缘关系分析，确定个体之间的亲缘关系，对于研究叶城沙蜥的繁殖行为和种群动态具有重要意义；基因定位和基因组图谱构建，为深入研究叶城沙蜥的基因功能和遗传调控机制奠定基础。

1.4研究目的与内容

本研究旨在通过筛选叶城沙蜥的微卫星位点，分析其种群遗传结构，为叶城沙蜥的保护遗传学研究提供基础数据和理论支持。具体研究内容包括：运用高通量测序技术或磁珠富集法等方法，筛选出多态性丰富的叶城沙蜥微卫星位点，并对其进行引物设计和验证；采集塔里木盆地不同区域的叶城沙蜥样本，提取基因组DNA，利用筛选出的微卫星引物进行PCR扩增，获得基因分型数据；运用相关软件和分析方法，如STRUCTURE、Arlequin等，对基因分型数据进行分析，评估叶城沙蜥种群的遗传多样性参数，如等位基因丰富度、期望杂合度、观测杂合度等；分析种群间的遗传分化程度，确定遗传分化系数（FST），绘制种群遗传结构图谱，探讨叶城沙蜥种群的遗传结构和基因流模式；结合地理信息和环境数据，探究影响叶城沙蜥种群遗传结构的因素，如地理隔离、生态环境差异等，为制定科学合理的保护策略提供依据