甘草属植物DNA条形码标记的筛选鉴定及应用效能分析.docxVIP

甘草属植物DNA条形码标记的筛选鉴定及应用效能分析

目录

甘草属植物DNA条形码标记的筛选鉴定及应用效能分析（1）．．．．．．．3

一、内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

（一）研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

（二）研究目的与内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

二、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

（一）实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

（二）实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

（三）数据分析与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

三、甘草属植物DNA条形码标记的筛选与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

（一）候选条形码序列的筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

（二）条形码序列的比对与验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

（三）条形码标记的特异性与稳定性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

四、甘草属植物DNA条形码标记的应用效能分析．．．．．．．．．．．．．．．．．26

（一）鉴定准确性评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

鉴定准确率．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

鉴定效率．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

（二）系统发育关系分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

（三）遗传多样性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

五、案例研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

（一）甘草属植物鉴定实例．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49

（二）应用条形码标记进行物种鉴定的优势与局限性．．．．．．．．．．．．51

六、结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．53

（一）研究结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．55

（二）未来研究方向与应用前景展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56

甘草属植物DNA条形码标记的筛选鉴定及应用效能分析（2）．．．．．．60

文档概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．60

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．61

1.2全球甘草属植物资源分布及分类现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．62

1.3DNA条形码技术概述及其在植物鉴定中的应用潜力．．．．．．．．．．．64

1.4本研究的目标与创新点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．66

材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．68

2.1研究样本的采集与保存．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．69

2.2DNA提取与质量检测方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．73

2.3核心DNA条形码候选片段的筛选过程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．75

2.3.1片段选择依据．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．76

2.3.2载体特异性基因库的初步筛选标准．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．79

2.4基因片段PCR扩增与测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．80

2.5序列比对与系统发育分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．83

结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．85

3.1DNA条形码候选片段的扩增效率评价．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．87

3