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甘肃2025自考[生物医药数据科学]生物信息学易错题专练

一、单选题（共10题，每题2分）

1.在生物信息学中，用于比较基因序列相似性的算法是？

A.聚类分析

B.多序列比对

C.主成分分析

D.决策树

2.下列哪个工具常用于构建基因调控网络？

A.BLAST

B.Cytoscape

C.GSEA

D.KEGG

3.生物信息学中，k-mer的概念主要应用于？

A.基因表达分析

B.序列比对

C.蛋白质结构预测

D.代谢通路分析

4.下列哪个数据库主要存储基因组注释信息？

A.PubMed

B.UniProt

C.NCBIGenBank

D.PDB

5.在RNA-Seq数据分析中，常用的差异表达分析方法不包括？

A.DESeq2

B.edgeR

C.K-means

D.limma

6.生物信息学中，序列拼接指的是？

A.将多个短序列合并成一个长序列

B.对序列进行去冗余处理

C.将基因序列翻译成蛋白质序列

D.对序列进行质心聚类

7.下列哪个工具用于构建系统发育树？

A.SAMtools

B.RAxML

C.FastQC

D.HISAT2

8.在蛋白质结构预测中，AlphaFold主要基于？

A.机器学习

B.遗传算法

C.贝叶斯模型

D.聚类分析

9.生物信息学中，批次效应指的是？

A.实验样本之间的随机差异

B.数据库中的冗余信息

C.序列比对中的错配率

D.软件版本不一致导致的误差

10.下列哪个数据库存储了大量的蛋白质功能注释信息？

A.GenBank

B.Ensembl

C.UniProt

D.STRING

二、多选题（共5题，每题3分）

1.生物信息学中，常用的序列比对工具包括？

A.BLAST

B.ClustalW

C.MAFFT

D.Samtools

2.RNA-Seq数据分析的主要步骤包括？

A.数据质量控制

B.基因表达量计算

C.差异表达分析

D.通路富集分析

3.生物信息学中，常用的系统发育分析方法包括？

A.NJ法

B.MP法

C.ME法

D.贝叶斯法

4.蛋白质结构预测中，常用的模型包括？

A.AlphaFold

B.I-TASSER

C.Rosetta

D.RaptorX

5.生物信息学中，常用的数据库包括？

A.NCBI

B.EMBL

C.DDBJ

D.UniProt

三、判断题（共10题，每题1分）

1.BLAST算法主要用于查找基因序列的同源性。（√）

2.k-mer长度越大，序列拼接的准确性越高。（×）

3.RNA-Seq数据分析中，常用的统计方法包括t检验和方差分析。（√）

4.蛋白质结构预测中，AlphaFold2主要基于深度学习技术。（√）

5.生物信息学中，批次效应可以通过标准化方法消除。（√）

6.系统发育树主要用于研究物种进化关系。（√）

7.基因组注释数据库主要存储基因的物理位置和功能信息。（√）

8.聚类分析常用于基因表达数据的降维处理。（×）

9.FastQC主要用于序列质量控制。（√）

10.KEGG数据库主要存储代谢通路信息。（√）

四、简答题（共5题，每题5分）

1.简述BLAST算法的基本原理。

2.解释RNA-Seq数据分析中的差异表达分析。

3.生物信息学中，系统发育树有什么作用？

4.蛋白质结构预测有哪些常用方法？

5.如何解决生物信息学中的批次效应问题？

五、论述题（共1题，10分）

结合甘肃生物医药行业的特点，论述生物信息学在疾病诊断与治疗中的应用前景。

答案与解析

一、单选题

1.B

解析：多序列比对（MultipleSequenceAlignment,MSA）是生物信息学中常用的算法，用于比较多个基因或蛋白质序列的相似性。

2.B

解析：Cytoscape是一款开源的分子互动网络分析软件，常用于构建基因调控网络、蛋白质相互作用网络等。

3.B

解析：k-mer是序列拼接（如deBruijn图）和序列搜索（如BLAST）中的核心概念，通过将序列分割成固定长度的子串（k-mer）进行分析。

4.C

解析：NCBIGenBank是全球最大的基因组数据库，存储了大量的基因组注释信息。

5.C

解析：K-means是聚类分析算法，不适用于基因表达数据的差异表达分析。

6.A

解析：序列拼接是指将多个短序列（如测序读长）合并成一个完整的长序列。

7.B

解析：RAxML是一款常用的系统发育树构建软件，基于最大似然法。

8.A

解析：AlphaFold是基于深度学习的蛋白质结构预测模型，利用大量蛋白质结构数据进行训练