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猪源肠外致病性大肠杆菌的流行病学特征与Ydiv基因功能解析

一、引言

1.1研究背景与意义

猪源肠外致病性大肠杆菌（ExtraintestinalPathogenicEscherichiacoli，ExPEC）是一类能在猪的肠外部位，如血液、泌尿系统、呼吸系统等引发感染的病原菌。在养猪业中，由猪源ExPEC导致的疾病频发，给养猪业带来了沉重的经济负担。仔猪黄痢、白痢以及水肿病等常见疾病，均与猪源ExPEC感染紧密相关，这些疾病不仅致使仔猪的发病率和死亡率大幅攀升，还会对育肥猪和母猪的健康产生影响，进而降低养殖效益。

猪源ExPEC还对公共卫生构成了潜在威胁。由于其具备耐药基因和毒力基因，并且能够在动物和人类之间传播，这就使得猪源ExPEC成为了人类感染的潜在病原菌。耐药基因在猪源ExPEC中的存在，可能会通过食物链或环境传播至人类病原菌，从而导致人类感染难以治疗，这给公共卫生安全带来了严峻挑战。

深入了解猪源ExPEC的流行病学特征，如感染率、流行菌株的分布、传播途径以及耐药性状况等，对于制定科学有效的防控措施至关重要。掌握这些信息，能够帮助养殖者采取针对性的预防手段，减少疾病的发生和传播。对猪源ExPEC中特定基因功能的研究，如Ydiv基因，有助于揭示其致病机制，为研发新型治疗方法和药物提供坚实的理论基础。

1.2国内外研究现状

在国内外，针对猪源肠外致病性大肠杆菌的研究已经取得了一定成果。国外学者在猪源ExPEC的种群结构、毒力因子和耐药性等方面进行了深入研究。有研究表明，不同地区的猪源ExPEC在种群结构上存在差异，且毒力因子的分布与致病性密切相关。在耐药性研究方面，发现猪源ExPEC对多种抗生素呈现出耐药性，耐药基因的传播机制也逐渐被揭示。

国内研究也对猪源ExPEC的分离鉴定、血清型分布和耐药性进行了大量工作。有研究报道了国内不同地区猪源ExPEC的主要血清型以及耐药谱，为临床防治提供了重要参考。近期华中农业大学郑金水/谭臣教授团队对来自中国的499种猪源性ExPEC分离株进行了大规模基因组测序和抗生素耐药性测试，发现中国的猪源性ExPEC具有高度的遗传多样性，且普遍存在抗生素抗性基因，这些基因通常与共转移机制相关，还发现携带fosA3、blaCTX-M-14和mcr-1基因的质粒在猪源ExPEC和人类源沙门氏菌之间的传播。

然而，当前研究仍存在一些不足。在流行病学调查方面，不同地区的研究结果存在差异，缺乏全面系统的全国性流行病学数据，对于猪源ExPEC在不同养殖环境和猪群中的感染规律了解不够深入。在基因功能研究方面，虽然已经鉴定出一些毒力基因和耐药基因，但对于许多基因的具体功能和调控机制仍不清楚，特别是像Ydiv这样的基因，其在猪源ExPEC致病过程中的作用尚未见报道。

1.3研究目标与内容

本研究旨在通过对猪源肠外致病性大肠杆菌进行全面的流行病学调查，深入了解其在不同地区、不同养殖环境下的感染率、流行菌株分布、血清型以及耐药性等特征，为养猪业的疾病防控提供科学依据。具体内容包括：从不同地区的猪场采集样品，分离鉴定猪源ExPEC；运用分子生物学技术，对分离菌株进行血清型鉴定和耐药基因检测；采用药敏试验，测定菌株对常用抗生素的耐药性，分析耐药谱。

同时，本研究聚焦于Ydiv基因功能的研究，揭示其在猪源ExPEC致病过程中的作用机制，为开发新的治疗靶点和防控策略奠定基础。具体内容包括：构建Ydiv基因缺失突变株和互补株；通过细胞感染实验和动物模型，比较野生株、突变株和互补株的致病性差异；运用转录组学和蛋白质组学技术，分析Ydiv基因对猪源ExPEC基因表达和蛋白质表达的影响，探究其调控网络。

二、猪源肠外致病性大肠杆菌的流行病学调查

2.1材料与方法

2.1.1样本采集

本研究从[具体省份]的[X]个规模化猪场和[X]个散养户中采集样品，涵盖了不同养殖规模和养殖环境，以确保样本具有广泛的代表性。采集时间从[开始时间]至[结束时间]，为期[时长]，分多个批次进行采样，以反映不同季节猪源肠外致病性大肠杆菌的感染情况。

采集的样本包括病猪的肝脏、肺脏、脾脏、淋巴结、关节积液和心包积液等肠外组织。对于规模化猪场，按照一定比例随机选取具有发热、腹泻、呼吸困难、关节肿胀等疑似感染症状的病猪进行采样；对于散养户，对出现上述症状的病猪全部进行采样。采样时严格遵循无菌操作原则，使用无菌器械采集病料，并立即将其放入含有饱和氯化钠溶液或30%甘油缓冲盐水溶液的采样管中，以维持细菌的活性。样品采集后，在0-4℃的低温条件下保存和运输，确保在72小时内送达实验室进行后续检测。