第三章蛋白质的三维结构.ppt

Thethree-dimensionalstructureofbovinepancreatictrypsininhibitor.Notethestabilizationofthea-helixbyahydrogenbondtoSer47andthestabilizationoftheb-sheetbyAsn43.?氢键：是非共价键中键能最弱，但数目最多最重要的键。第93页，共144页，星期日，2025年，2月5日第94页，共144页，星期日，2025年，2月5日（2）范德华力（分子间及基团间作用力）包括三种弱的作用力：

定向效应极性基团间

诱导效应极性与非极性基团间

分散效应非极性基团间第95页，共144页，星期日，2025年，2月5日（3）疏水相互作用蛋白质中的疏水残基避开水分子而聚集在分子内部的趋向力。它在维持蛋白质的三级结构方面占有突出的地位。

CH2-CH-CO-NH-CH2-CH-CO-NH--NH-CH-CO-CH3CH3-NH-CH-CO第96页，共144页，星期日，2025年，2月5日（4）离子键（盐键）是正电贺和负电荷之间的一种静电作用。

生理pH下，Asp、Glu侧链解离成负离子，Ｌys、Arg、His离解成正离子。多数情况下，这些基团分布在球状蛋白质分子的表面，与水分子形成排列有序的水化层。偶尔有少数带相反电荷的测链在分子的疏水内部形成盐键。

第97页，共144页，星期日，2025年，2月5日（5）共价健主要的是二硫键，

在二硫键形成之前，蛋白质分子已形成三级结构，二硫键不指导多肽链的折叠，三级结构形成后，二硫键可稳定此构象。

主要存在于体外蛋白中，在细胞内，由于有高浓度的还原性物质，所以没有二硫键。

第98页，共144页，星期日，2025年，2月5日（6）静电相互作用最强的静电作用就是带相反电何的离子基因间的静电作用，又称盐桥。盐桥和较弱的静电相互作用(离子-偶级、偶级-偶级、范德华力)也是维持亚基间以及蛋白质与配体间的作用力。第99页，共144页，星期日，2025年，2月5日第100页，共144页，星期日，2025年，2月5日七蛋白质的四级结构具有二条或二条以上独立三级结构的多肽链组成的蛋白质，其多肽链间通过次级键相互组合而形成的空间结构称为蛋白质的四级结构(quarternarystructure)。其中，每个具有独立三级结构的多肽链单位称为亚基(subunit)。第101页，共144页，星期日，2025年，2月5日β-转角(β-turn)要点：定义：多肽链中的某局部出现180度回折处形成的特定构象。特征：一般由四个氨基酸组成，常见氨基酸：Pro,Gly,Asp,Asn,Trp以氢键维持稳定，第1个氨基酸残基的C=O与第4个残基的N-H之间形成氢键。赋予蛋白质较大的构象柔性，常位于三维结构的表面，有些具有特定功能。第61页，共144页，星期日，2025年，2月5日Threedifferentkindsofb-bulgestructuresinvolvingapairofadjacentpolypeptidechains.(AdaptedfromRichardson,J.S.,1981.AdvancesinProteinChemistry34:167–339.)第62页，共144页，星期日，2025年，2月5日4、无规卷曲没有规律的多肽链主链骨架构象。

球状蛋白中含量较高，对外界理化因子敏感，与生物活性有关。

α-螺旋，β-转角，β-折叠在拉氏图上有固定位置，而无规卷曲的φ、Ψ二面角可存在于所有允许区域内。第63页，共144页，星期日，2025年，2月5日第64页，共144页，星期日，2025年，2月5日α-螺旋(α-helix)β-折叠(β-pleatedsheet)β-转角(β-turn)蛋白质空间结构单元环(loop)无规则卷曲（randomcoil）Ribbonmodelofthebacterialcatabolitegeneactivatorprotein(CAP)第65页，共144页，星期日，2025年，2月5日五、超二级结构和结构域（一）超二级结构

由若干个相邻的二级结构单元（α-螺旋、β-折叠、β-转角及无规卷曲）组合在一起，彼此相互作用，形成有规则的、在空间上能够辨认的二级结构组合体。★超二级