蛋白质理化性质.pptVIP

折叠能量“地貌”原理图未折叠的蛋白具有高的构象熵和高的能量。折叠过程中漏斗变窄表示构象的种类下降。两边的低洼处表示半稳定的中间体，这些中间体可以减慢折叠过程。底部表示所有的中间体都到达了天然结构。第29页，共81页，星期日，2025年，2月5日有人提出若某一多肽链具有2种低能量状态：一种是天然构象，一种是非天然构象，而且处于这2种能量状态的多肽链的相互转变由于要克服较高的能垒而难以实现，那么在蛋白折叠过程中会有2种途径相互竞争，一种是正确折叠成天然构象的途径，另一种是错误折叠成稳定的非天然构象途径。第30页，共81页，星期日，2025年，2月5日1型人胰岛素生长因子实验存在2种稳定构象天然构象错配二硫键的非天然构象多肽链具相似自由能但二级结构成分不同第31页，共81页，星期日，2025年，2月5日3.“动力学假说”90年代辅助蛋白(Accessory?protein)的发现——细胞内新生肽段的折叠一般意义上说是需要帮助的，而不是自发进行的。帮助蛋白质折叠的生物大分子主要是分子伴侣和折叠酶。不仅仅受“热力学”控制，也受到“动力学”的控制。第32页，共81页，星期日，2025年，2月5日一级结构二级结构疏水塌缩前熔球态高度有序的熔球态天然态快过程毫秒内疏水塌缩、氢键的形成和二级结构单元的堆积慢过程，从100ms到几分钟，几小时不等。在折叠过程中脯氨酰从非天然的反式构象向天然态的顺式构象转变的慢异构化过程导致了折叠的慢相反应第33页，共81页，星期日，2025年，2月5日第34页，共81页，星期日，2025年，2月5日Therulesgoverningproteinfoldingarecomplex热力学动力学特殊蛋白？？？被列为“21世纪的生物物理学”的重要课题第35页，共81页，星期日，2025年，2月5日四、折叠机制的理论模型1框架模型（FrameworkModel）

???框架模型假设蛋白质的局部构象依赖于局部的氨基酸序列。在多肽链折叠过程的起始阶段,先迅速形成不稳定的二级结构单元；称为“flickeringcluster”,随后这些二级结构靠近接触,从而形成稳定的二级结构框架；最后，二级结构框架相互拼接，肽链逐渐紧缩，形成了蛋白质的三级结构。这个模型认为即使是一个小分子的蛋白也可以一部分一部分的进行折叠,其间形成的亚结构域是折叠中间体的重要结构。第36页，共81页，星期日，2025年，2月5日2.疏水塌缩模型（HydrophobicCollapseModel）

????在疏水塌缩模型中，疏水作用力被认为是在蛋白质折叠过程中起决定性作用的力的因素。在形成任何二级结构和三级结构之前首先发生很快的非特异性的疏水塌缩。——疏水内核包埋

折叠机制的理论模型第37页，共81页，星期日，2025年，2月5日3.扩散-碰撞-粘合机制（Diffusion-Collision-AdhesionModel）

??该模型认为蛋白质的折叠起始于伸展肽链上的几个位点，在这些位点上生成不稳定的二级结构单元或者疏水簇，主要依靠局部序列的近程或中程（3-4个残基）相互作用来维系。它们以非特异性布朗运动的方式扩散、碰撞、相互黏附，导致大的结构生成并因此而增加了稳定性。进一步的碰撞形成具有疏水核心和二级结构的类熔球态中间体的球状结构。球形中间体调整为致密的、无活性的类似天然结构的高度有序熔球态结构。最后无活性的高度有序熔球态转变为完整的有活力的天然态。折叠机制的理论模型第38页，共81页，星期日，2025年，2月5日4.成核-凝聚-生长模型（Nuclear-Condensation-GrowthModel）

??根据这种模型，肽链中的某一区域可以形成“折叠晶核”，以它们为核心，整个肽链继续折叠进而获得天然构象。所谓“晶核”实际上是由一些特殊的氨基酸残基形成的类似于天然态相互作用的网络结构，这些残基间不是以非特异的疏水作用维系的，而是由特异的相互作用使这些残基形成了紧密堆积。晶核的形成是折叠起始阶段限速步骤。折叠机制的理论模型第39页，共81页，星期日，2025年，2月5日5.拼版模型（Jig-SawPuzzleModel）

??此模型的中心思想就是多肽链可以沿多条不同的途径进行折叠,在沿每条途径折叠的过程中都是天然结构越来越多,最终都能形成天然构象,而且沿每条途径的折叠速度都较快,与单一途径折叠方式相比,多肽链速度较快,另一方面,外界生理生化环境的微小变化或突变等因素可能会给单一折叠途径造成较大的影响，而对具有多条途径的折叠方式而言,这些变化可能给某条折