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甜瓜CmUGT8基因功能及生物信息分析
目录
内容简述与背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3
1.1研究意义与价值．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.2甜瓜发育与品质改良概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
1.3CmUGT8基因初步研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
1.4本研究目的与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
2.1研究材料与来源．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
2.1.1甜瓜品种介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
2.1.2载体与试剂准备．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
2.2实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
2.2.1基因组DNA提取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
2.2.2CmUGT8基因克隆与测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
2.2.3生物信息学分析策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
2.2.4基因转录水平检测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
2.2.5转基因构建与表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
2.2.6表型观测与数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
CmUGT8基因的生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
3.1基因序列特征分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38
3.1.1全长与开放阅读框．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
3.1.2编码蛋白质理化性质推测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
3.2同源序列比对与系统发育构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
3.2.1CmUGT8与同科属基因的序列比对．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44
3.2.2基于系统发育树的进化关系探究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47
3.3蛋白质结构预测与功能域分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49
3.3.1跨膜区域与胞外结构域．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51
3.3.2可能的功能位点与结合域．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．53
CmUGT8基因的表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56
4.1不同组织部位中的表达分布．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．61
4.2不同发育阶段的表达变化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．62
4.3不同环境胁迫下的表达响应．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．65
4.4CmUGT8转录因子互作分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．66
CmUGT8基因功能验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．69
5.1CmUGT8基因沉默/失活的效果观察．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．72
5.2转基因植株的表型比较分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．73
5.2.1果实外观与大小变化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．76
5.2.2果实营养成分测定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．78
5.2.3抗逆性差异评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．79
讨论与结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．82
6.1研究结果汇总与意义阐
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