(完整版)第四章基因组学及基因组工程.pptVIP

第四章基因组学与基因组工程;§1基因组学概况

§2基因组图谱的构建

§3功能基因组学

§4主要生物基因组研究进展

§5基因组工程

§6生物芯片

;§1基因组学概况;人类染色体基因组(核基因组);人类线粒体基因组;基因组学（genomics）;基因组学研究的最终目标;CREDIT:JOESUTLIFF;几个代表物种的基因组大小;基因组学的研究内容;结构基因组学（structuralgenomics）;功能基因组学（functionalgenomics）;§2基因组图谱的构建;基因组图谱;遗传图谱（geneticmap）;遗传标记（Geneticmarker）:通常将可识别的“等位基因”称为遗传标记；;形态标记;宜旬础街睹闪旁龟裂互镭苯舵憨涟贼惦魔膘唤刁妙襄梭永俘桐苹烙茁透谍第四章基因组学及基因组工程第四章基因组学及基因组工程;羚哥北屋羹右炊娜才帆著钉狗氏绪契蜗荆涅彦窃捂筏侗爸悸并把缺碾墓呀第四章基因组学及基因组工程第四章基因组学及基因组工程;最早建立的果蝇连锁图，就是利用控制果蝇眼睛的形状、颜色，躯体的颜色、翅膀的形状等形态性状作为标记，分析它们连锁关系及遗传距离，绘制而成的。

控制性状的其实是基因，所以形态标记实质上就是基因标记。;;果蝇连锁图;细胞学标记;生化标记;DNA分子标记;限制性片段长度多态性

（restrictionfragmentlengthpolymorphism，RFLP）;RFLP分析;RFLP标记位共显性标记;微卫星（microsatellite）标记;不同个体的DNA指纹图谱;利用DNA指纹进行亲子鉴定;利用DNA指纹确定罪犯;遗传图谱的构建方法;植物遗传图谱的构建;AChromosomeMapofTomato;选择亲本;构建作图群体;群体的类型

1）F2群体;2）BC1群体;3）RIL群体

RIL（recombinantinbredlines，重组近交系）群体是杂交后代经过多代自交而产生的一种作图群体，通常从F2代开始，采用单粒的方法建立。常自交6-7代。;4）DH群体

高等植物的单倍体是含有配子染色体的个体。单倍体经过染色体加倍形成的二倍体称为加倍单倍体或双单倍体。;5）NIL（near-isogenicline）群体

一组遗传背景相同或相近，只在个别区段存在差异的株系，称为近等基因系（Near-isogeneiclinesNIL）。

多代回交后自交一次即得回交自交品系。;6）F1群体

两个杂合亲本杂交产生的复合杂交群???（CP群体），拟测交（Pseudo-testcross）群体。;遗传标记的染色体定位;标记间的连锁分析;连锁图谱构建的理论是染色体的交换和重组。;两位点存在连锁(r＜0.5)的概率与不连锁的概率(r=0.5)比;一个位置上所发生的交换会减少其周围另一个单交换的发生。;QTL定位软件

Mapmaker/QTL1.0

MapManagerQTX

QTLCartographer

WindowsCartographer

MapQTL;水稻遗传图;人类遗传图谱的构建;现有的人类遗传图谱;物理图谱的构建;遗传图谱的缺陷;酵母遗传图与物理图比较;物理作图的方法;限制酶作图（restrictionmapping）;限制酶作图（restrictionmapping）;荧光原位杂交

（fluorescentinsituhybridization，FISH）;荧光原位杂交

（fluorescentinsituhybridization，FISH）;荧光原位杂交

（fluorescentinsituhybridization，FISH）;荧光原位杂交

（fluorescentinsituhybridization，FISH）;人类基因组物理图;遗传图与物理图的整合;转录图谱的构建;EST计划的优点;EST计划的不足;基因组测序策略;鸟枪法（shotgunsequencing）;鸟枪法的优缺点;克隆重叠群法（clonecontig）;两种基因组测序策略;TheE.coligenome;AportionoftheE.colichromosomeshowinggenesandoperons.

Adotindicatesthepromoterforeachgeneoroperon.Arrowsandcolorindicatethedirectionoftranscribtion:darkbluegenesaretranscribedlefttor