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2025年大学《生物统计学》专业题库——生物统计学在基因表达分析中的应用
考试时间:______分钟总分:______分姓名:______
一、选择题(每题3分,共30分)
1.在基因表达谱数据分析中,对原始计数数据进行对数转换(如Log2)的主要目的是?
A.消除数据中的批次效应
B.使数据分布更接近正态分布
C.降低数据中的噪声水平
D.标准化不同基因的表达量范围
2.比较两组(例如处理组与对照组)基因平均表达量差异时,如果样本量较小且两组方差相等,最常用的基础统计方法是?
A.方差分析(ANOVA)
B.卡方检验
C.t检验
D.主成分分析(PCA)
3.在比较多个处理组(例如三种药物处理组与对照组)的基因表达差异时,如果假定各组方差相等且每个处理组有多个重复样本,应优先考虑使用?
A.单因素t检验
B.多重t检验(未校正)
C.单因素方差分析(ANOVA)
D.聚类分析
4.假设检验中,p值表示的是?
A.观察到的统计量或更极端结果在零假设成立时出现的概率
B.零假设为真时,接受备择假设的概率
C.零假设为假时,拒绝零假设的概率
D.数据的可靠性程度
5.在进行差异表达基因分析时,使用FDR(FalseDiscoveryRate)而不是p值的主要原因是?
A.FDR总是比p值更小
B.FDR能控制所有错误发现的比例,而p值仅控制单个检验的错误发现率
C.FDR适用于大数据集,p值适用于小数据集
D.FDR计算更简单
6.当基因表达数据包含多个相关基因,且目标是识别共同的调控模式或通路时,以下哪种方法最为合适?
A.单个基因的t检验
B.基因集富集分析(GSEA)
C.主成分分析(PCA)
D.独立样本t检验
7.在基因表达时间序列分析中,如果考虑处理效应、时间效应以及处理与时间的交互效应,最适合的统计模型是?
A.简单线性回归
B.双因素方差分析
C.线性混合效应模型(LMM)
D.单因素方差分析
8.对于高维基因表达数据(基因数量远大于样本数量),常用的第一步降维方法是?
A.因子分析
B.线性判别分析(LDA)
C.主成分分析(PCA)
D.聚类分析
9.在评估一个差异表达分析结果的可靠性时,除了看p值或FDR,还应关注?
A.基因表达变化的倍数大小
B.效应量的估计
C.模型拟合优度
D.数据的重复性
10.对基因表达数据进行聚类分析的主要目的是?
A.检测基因之间的统计学关联性
B.识别具有相似表达模式的基因或样本
C.比较不同基因的表达量高低
D.对样本进行分类以预测其来源
二、填空题(每空2分,共20分)
1.对于来自不同生物学实验或不同实验批次的数据,需要通过标准化方法来减少______,确保数据具有可比性。
2.在进行差异表达分析时,假设检验的零假设通常认为______与______的基因表达水平没有差异。
3.方差分析(ANOVA)可以用来同时比较______个组别之间的均值差异,并检验______效应的存在。
4.p值小于0.05通常被认为是统计显著性的一个常用阈值,它表示在零假设为真的情况下,观察到当前结果或更极端结果的概率小于______。
5.主成分分析(PCA)是一种降维技术,它可以将原始的多个变量转化为少数几个______,并尽量保留原始数据的变异信息。
6.当基因表达数据中存在未知的分组信息时,可以使用______方法来探索性地识别具有不同表达模式的样本或基因。
7.线性混合效应模型(LMM)特别适用于处理具有______结构的数据,例如重复测量数据或分层数据。
8.基因集富集分析(GSEA)用于判断一个预定义的基因集中,是否存在显著富集的______或______基因。
9.统计模型的假设是进行有效性检验的基础,例如ANOVA要求数据满足______、______和______。
10.在对基因表达数据进行分类预测时,判别分析(LDA)旨在找到一个最优的线性判别函数,以最大化不同类别样本间的______,同时最小化类内离散度。
三、简答题(每题8分,共24分)
1.简述在基因表达分析中进行数据标准化(归一化)的必要性和常用方法。
2.简要比较t检验和方差分析(ANOVA)在分析基因表
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