阴地蕨属药用植物光合作用关键酶RuBisCO的核质协同进化研究.pdfVIP

2025第二十七卷第期★Vol.27No.1

阴地蕨属药用植物光合作用关键酶RuBisCO的

核质协同进化研究*

1,2,31,2,3

曾宇灵，朱明玉，李伟，刘义飞张景景，

1,2,3**

雷笛1.23**，森林

（1.湖北中医药大学药学院430065；2.湖北中医药大学教育部重点实验室430065;

武汉武汉

3.湖北时珍实验室武汉430065)

为为深入探究药用阴地蕨属植物的系统发育关系、分子鉴定方法和光合作用关键酶

摘要：目的

RuBisCO的进化规律，采集阴地蕨（Botrychiumternatum（Thunb.）Sw.）和蕨其（Botrychiumvirginianum

(L.）Sw.)开展序列测定和数据挖掘。方法本研究结合二代短读长和三代长读长数据完整测定并混合

组装了阴地蕨和蕨其的叶绿体基因组。利用组装结果、GenBank库和SRA库中的公开数据，提取叶绿体

基因组编码区和核基因rbcS编码区分别重建了18种蕨类植物的系统发育关系。随后开展光合作用关

键酶RuBisCO大小亚基编码序列rbcL和rbcS的适应性进化及共进化分析。结果两种叶绿体基因组全

长分别为139063bp（NC_060644）和139372bp（0R609363），物种之间有很高的共线性关系，物种内的反

向重复区的共线性显著；分别蕴含着92个和78个cpSSR位点，具备作为分子标记的潜力。叶绿体基因

组组装结果中的rbcL基因与转录组测序结果重建所得rbcS基因共进化分析表明：①蕨类植物中rbcL与

rbcS基因存在显著的共进化网络；②RBCL、RBCS亚基中存在受到正选择的位点；③其中来自RBCL的位

点11与RBCS的位点106既存在正选择又显示共进化，揭示蕨类植物的RuBisCO酶存在来自叶绿体基因

组和核基因组的协同进化。结论

仑本研究为药用阴地蕨属植物及近缘物种系统发育关系和分子鉴定提

供了理论依据和数据支持，还为探索阴地蕨属植物RuBisCO酶的适应性进化与共进化提供了新视角，诠

释了蕨类植物在长期适应地球环境变化中的细胞器与细胞核相互协同的进化规律。

关键词：RuBisCO酶叶绿体基因组rbcS基因

每阴地蕨属共进化分析

D0I:10.11842/wst.20240302003CSTR:32150.14.wst.20240302003中图分类号：R282.71文献标识码：A

阴地蕨属（BotrychiumSw.)是一类矮小的多年生草株均可人药[],并且在民族医学和民间医学中的广泛应

本植物，属于瓶尔小草目（Ophioglossale）阴地蕨科用具有悠久历史[4.6]。中医药认为其作用于内，具有清热

（Botrychiaceae），被认为是典型的异源多倍体植物,形利水、平肝风、消肿、止咳、止血明目等临床效用，常用于

态简单，具备营养叶和孢子叶的区分2。我国分布有治疗毒蛇咬伤、痛疽恶疮、肺热咳嗽[3.7]。现代药理学研

9种阴地蕨属药用植物[3]。自1977年起，阴地蕨属植物究表明阴地蕨属具有镇咳、抗菌、抗氧化、抗肿瘤和增强

开始收录于《中华人民共和国药典》4。阴地蕨属植物整免疫力的药用成分(6.8-9。阴地蕨属植物分布广泛，主要

收稿日期：2024-03-02

修回日期：2024-10-27

国家自然科学基金委员会青年基金项目：中国阴地蕨属药用草本植物系统学及分子进化研究，负责人：森林；刘合钢全国名老中

医药专家传承工作室建设项目，负责人：刘合刚。

**通讯作者：雷笛（0RCID：0000-0001-5899-857X)，博士，湖北中医药大学在站博后，主要研究方向：植物系统