基于种子发育转录组的豌豆bZIP基因家族分析及种子发育候选基因的鉴定.pdfVIP

作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2025,51(4):914931/

ISSN0496-3490;CN11-1809/S;CODENTSHPA9E-mail:zwxb301@

DOI:10.3724/SP.J.1006.2025.44123

基于种子发育转录组的豌豆bZIP基因家族分析及种子发育候选基因

的鉴定

周恩强缪亚梅周瑶姚梦楠赵娜王永强朱宇翔薛冬

李宗迪石宇欣李波汪凯华顾春燕王学军*魏利斌*

江苏沿江地区农业科学研究所,江苏南通226012

摘要:bZIP基因广泛参与种子发育、光信号调节和胁迫响应等生理过程。然而,目前对豌豆PastbZIP基因调控种

子发育知之甚少。为鉴定豌豆种子发育相关PastbZIP基因,揭示其进化关系,本研究利用生物信息学和种子发育转

录组数据对PastbZIP基因家族进行鉴定与进化分析,并通过比较基因组学挖掘种子发育相关PastbZIP基因,同时利

用蛋白互作网络和qRT-PCR对其验证。在豌豆种子发育转录组数据中共鉴定出62个PastbZIP基因,根据系统进化

特征将PastbZIP基因分为9组,不同亚家族在蛋白理化性质、基因结构、保守基序等方面表现出进化多样性和差异

性。共线性分析发现,豌豆与大豆、苜蓿、拟南芥和蚕豆分别有54、23、8和22对共线性基因,并且发现片段复制

是PastbZIP基因家族扩张的主要驱动力,而且这些基因的进化是通过纯化选择来实现的。KEGG富集分析显示,

PastbZIP主要富集在植物激素信号转导通路中,且PastbZIP启动子顺式作用元件中包含大量的激素响应元件,有60

个(96.8%)PastbZIP基因包含5种激素响应元件。通过同源比对在豌豆中发现10个与种子发育相关的候选基因,且

其蛋白互作基因均参与调控种子发育。综上所述,本研究首次对豌豆种子发育相关PastbZIP家族成员进行了鉴定和进

化分析,并通过同源比对挖掘了种子发育候选基因,研究结果将为研究豌豆bZIP基因调控种子发育提供重要参考。

关键词:豌豆;PastbZIP;基因家族;种子发育;进化分析;蛋白互作网络

AnalysisofbZIPgenefamilyandidentificationofseeddevelopmentcandidate

genesinpeabasedonseeddevelopmenttranscriptome

ZHOUEn-Qiang,MIAOYa-Mei,ZHOUYao,YAOMeng-Nan,ZHAONa,WANGYong-Qiang,ZHU

*

Yu-Xiang,XUEDong,LIZong-Di,SHIYu-Xin,LIBo,WANGKai-Hua,GUChun-Yan,WANGXue-Ju