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38GRASSLANDANDTURF(2024)Vol.44No.2
草地早熟禾胚胎发生标记基因BBM的鉴定及
系统进化分析
*
余江弟,苗佳敏,李玉珠,马晖玲
(甘肃农业大学草业学院,草业生态系统教育部重点实验室,甘肃省草业工程实验室,中⁃美草地畜牧业
可持续发展研究中心,甘肃兰州730070)
摘要:【目的】利用生物信息学方法,鉴定草地早熟禾(Poapratensis)胚胎发生标记基因PpBBM,
并通过保守基序比对和进化树分析,推测可能具有孤雌生殖功能的PpBBM基因。【方法】基于草地早
熟禾转录组数据库信息,检索PpBBM基因。通过生物信息学软件分析PpBBMs蛋白理化特性,比较
不同PpBBMs蛋白的系统进化关系和保守基序差异。【结果】共获得3个具有完整开放阅读框的
PpBBMs基因,其编码的蛋白均含有2个AP2结构域,其中,PpBBM1和PpBBM2具有相同的motif类
型和数量。3个PpBBMs蛋白都是酸性蛋白,定位于细胞核,不存在跨膜结构和信号肽。系统进化分
析表明,30个物种的BBM/BBML蛋白成员共聚为5类。其中,PpBBM1、PpBBM2聚在第2分支,分别
与BdBBM和SbBBML亲缘关系最近;PpBBML位于第5分支,与ZmBBML亲缘关系最近。
PpBBM1、PpBBM2和PpBBML均具有BBM基因所特有的bbm-1基序以及AP2亚家族特定的
euANT2-4基序,但PpBBML蛋白的所有基序均有个别氨基酸残基存在变异。【结论】与PpBBML基
因相比,PpBBM1和PpBBM2更有可能具有诱导孤雌生殖的功能。
关键词:草地早熟禾;BBM基因;系统进化分析;保守基序
中图分类号:S688.4文献标志码:A文章编号:1009-5500(2024)02-0038-11
DOI:10.13817/j.cnki.cyycp.2024.02.004
[5]
无融合生殖能产生基因型与母本完全一致的种胚,从而保证只有母本基因型的克隆种子形成。隶
子,在固定作物杂种优势及降低制种成本方面有巨大属于AP2/ERF(APETALA2/ethylene-responsive
[1][2]factor)转录因子家族的BBM基因是植物胚胎发生过
潜力,是杂交育种的“无性生殖革命”。国际上将
[6]
程中的标记基因,在植物生长发育中具有多种功能,
被子植物无融合生殖的类型划分为3种,即二倍体孢
如促进细胞增殖和再生、提高遗传转化效率、诱导不
[3]
子生殖、无孢子生殖和不定胚生殖,前两者属于配子
定根的发生以及诱导无融合生殖等[7-12]。研究发现,
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